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南京农业大学考研复习-生物化学-蛋白质的生物合成.ppt

上传人:无敌 文档编号:396184 上传时间:2018-04-04 格式:PPT 页数:65 大小:1.72MB
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资源描述

1、蛋白质的生物合成,翻 译,蛋白质的生物合成,蛋白质生物合成:是指mRNA分子上核苷酸的遗传信息,变成蛋白质多肽链的氨基酸排列顺序的过程。翻译:遗传信息(碱基排列顺序,英文)由mRNA携带到蛋白质多肽链上体现为氨基酸残基排列顺序(中文)的过程,类似一种语言翻译成另一种语言时的情形相似,所以称为翻译。,特 点,翻译过程十分复杂 - 参与因素多 - 合成步骤繁,第一节 蛋白质合成体系,三、tRNA,四、核糖体,一、20种氨基酸,五、酶和辅助因子及无机离子、以ATP 、GTP,合成方向:NC端,二、 mRNA和遗传密码,翻译模板mRNA及遗传密码,* mRNA是遗传信息的携带者,遗传学将编码一个多肽的

2、遗传单位称为顺反子(cistron)。 原核生物的一段mRNA常常编码几种功能相关的蛋白质,这种mRNA被称为多顺反子(poly cistron)。,真核生物的一段mRNA常常只能编码一条多肽链,这种mRNA被称为单顺反子(single cistron)。,mRNA,(messenger RNA)是蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体,原核细胞mRNA的结构特点,5,3,先导区,AGGAGGU,SD区,一条mRNA链编码几种功能相关的蛋白质,真核细胞mRNA的结构特点,m7G-5ppp-N-3 p,AAAAAAA-OH,一条mRNA链只能为一种蛋白质编码,原核生物和真

3、核生物mRNA的比较,(一)密码子(codon): mRNA自53方向每三个碱基形成一个三联体,即一个遗传密码体现一个氨基酸信息 密码子的数量 43 =64 密码子的发现 : 1965年,Nirenberg用poly u加入C14标记的20种aa,仅有苯丙氨酸的寡肽,UUU=苯丙氨酸,最后用核苷酸的共聚物破译了全部密码,编出遗传密码表,遗 传 密 码,遗传密码表,密码子的特点,(1)连续性:两个密码子之间无任何核苷酸加以隔开和重叠,如插入/删除碱基,可发生移码突变或框移,密码子的特点,(2)简并性: 除Met,Trp外,其余氨基酸均由2个以上密码子编码。其中 UAG,UAA,UGA是终止密码子

4、,AUG是起始密码子同时又编码蛋氨酸;但细菌例外,在细菌中GUG表示起始的甲酰蛋氨酸(3)通用性:所有的生物使用同一套密码子,仅有少数例外,例如:线粒体起始密码子为AUG、AUU;终止密码为AGA,AGC;色氨酸为UGA等,密码子的特点,(四)摆动性:一种氨基酸可有多个密码子 反密码子与mRNA的第三个核苷酸配对时,不严格遵从碱基配对原则,可出现U-G,I-C,I-A,此种配对为不稳定配对,又称摇摆性。一般前两个碱基决定其专一性,第三位碱基可有变异,tRNA反密码环,mRNA,tRNA(transfer ribonucleic asid),tRNA 在蛋白质合成中处于关键地位,它不但为每个三联

5、体密码子译成氨基酸提供接合体,还为准确无误地将所需氨基酸运送到核糖体上提供运送载体,tRNA的三级结构示意图,tRNA与氨基酸的活化,反密码环,氨基酸臂,A C C,1 2 3,tRNA,1.结合氨基酸:氨基酸各有其特异的tRNA携带,一种氨基酸有几种tRNA携带,结合需要ATP供能,氨基酸结合在tRNA3-CCA的位置 2.反密码子:每种tRNA的反密码子,决定了所带氨基酸能准确的在mRNA上对号入座,同功受体tRNA:携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA。,?,tRNA,3.起始密码子:AUG表示甲硫氨酸,又是起始密码 真核生物甲硫氨酸:tRNAmet 原核为甲酰化的甲硫氨酸,用tR

6、NAfmet表示, tRNAfmet的甲酰基由N10-甲酰四氢叶酸提供,核糖体,是由rRNA(ribosomal ribonucleic asid)和多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键的合成就是在这种核糖体上进行的组成:大小亚基原核:30s + 50s 70s 真核: 40s + 60s 80s,核蛋白体的组成,原核生物核糖体的组成,核糖体,分类:一类附着于粗面内质网参与分泌蛋白的合成;另一类游离于胞质,参与细胞固有蛋白质的合成 功能:核糖体相当于装配机,大亚基有转肽酶活性,促进氨基酸合成肽,原核细胞70S核糖体的A位、P位及mRNA结合部位示意图,30S,与mRNA结合部

7、位,肽位:结合或接受肽基的部位,受位/氨基酰位:结合或接受AA-tRNA的部位,50S,P,A,T,转肽酶,多核蛋白体,5,3,一mRNA上可同时结合多个核蛋白体进行蛋白质多肽链合成,五、辅助因子,在蛋白质合成体系中,还有溶解在胞质中的蛋白质,在蛋白质合成的不同阶段起作用,分别有:,起始因子(IF):原核生物中有IF1、IF2、IF3,延长因子(EF):原核生物中有EF-Tu、EF-Ts、EF-G,终止因子(RF):原核生物中有RF1、RF2、RF3,蛋白质因子,参与翻译的蛋白质因子,阶段原核 真核 功 能IF1IF2 eIF2 参与起始复合物的形成IF3 eIF3、eIF4C起始 CBP I

8、 与mRNA帽子结合 eIF4A B F 参与寻找第一个AUG eIF5 协助eIF2、eIF3、eIF4C的释放 eIF6 协助60S亚基从无活性的核糖体上解离EF-Tu eEF1 协助氨酰-tRNA进入核糖体延长EF-Ts eEF1 帮助EF-Tu 、 eEF1周转 EF-G eEF2 移位因子终止 RF-1 eRF 释放完整的肽链 RF-2,因子前加“e” 表示真核生物(eukaryotic),五、辅助因子,ATP、GTP、Mg2+,其它因子,第二节 蛋白质的合成过程(以原核为例),一、氨基酸的活化与转运二、翻译起始三、肽链的延长四、肽链合成终止,一、氨基酸的活化与转运,氨基酸活化活化氨

9、基酸的搬运活化氨基酸与核蛋白体结合 1.参与活化转运的酶氨基酰-tRNA合成酶:特异性强,催化特定的氨基酸与特异的tRNA结合,每种氨基酸有特异的合成酶催化,此种特异性保证了遗传信息准确翻译,氨基酰tRNA的生成- 氨基酸的活化,氨基酰tRNA合成酶,ATP,PPi,氨基酰tRNA,2.催化过程氨基酸+ATP+tRNA氨基酰-tRNA+AMP+ppi,氨基酰tRNA的表示方法,丙氨基酰tRNA:ala-tRNAala,精氨基酰tRNA:arg-tRNAarg,甲硫氨基酰tRNA: met-tRNAmet,氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。(氨基酸相应的一组同功受体tR

10、NA) 氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。,起始密码子AUG编码的met由tRNAmet (真核) 或tRNAfmet(原核)转运,真核细胞起始密码子编码的met不须甲酰化,大肠杆菌起始密码子编码的met须甲酰化,原核生物中的fMet-tRNA的合成,Met + ATP + tRNA Met tRNA + AMP + PPi,甲硫氨(蛋氨)酰tRNA合成酶,一、氨基酸的活化,原核生物中的fMet-tRNA的合成,Met-tRNA在转甲酰酶的作用下,在其Met的-NH2上甲酰化。,fMet tRNA,一、氨基酸的活化,二、翻译起始(原核),30S

11、亚基 mRNA IF3- IF1复合物,30S mRNA GTP- fMet tRNA- IF2- IF1复合物,70S起始复合物,mRNA +30S亚基-IF3,mRNA中的SD序列与30s的互补序列结合,mRNA与30s形成复合物,IF1,IF3参与复合物的形成,核蛋白体上含给位p与受位A,AUG信号与给位相对应结合。同时fmet-tRNA的反密码子CAU与mRNA的AUG互补结合,50s的结合:50s与30s复合物形成70s启动前复合体,同时伴有GTP水解;IF1 IF2脱落,形成了启动复合体,fmet-tRNA的结合:与以上过程同时发生,fmet-tRNA辨认并与mRNA 模板中的AU

12、G结合。反应需IF2,GTP,Mg2+参与;而IF3脱落,70S启始复合物由大、小亚基,mRNA,fmet-tRNAfmet构成,三、肽链的延长,延长即核蛋白体自mRNA 5端向3端推进,反应需延长因子(elongation facters-EF)EFTu、GTP和无机离子参与,狭义的核蛋白体循环,进位,成肽,转位,Tu-GDP,GDP,Ts,Tu-Ts,Tu-GTP,GTP,Pi,氨基酰-tRNA进入A位,三、肽链的延长步骤,1.进位: aa进入受位,反应需GTP, Mg2+,EF-Tu(EF-Ts),Mg2+,K+,转肽酶,2.成肽(转肽与脱落):50s大亚基上的给位有肽酰转移酶活性,催化

13、给位的甲酰蛋氨酸与受位新进的aa结合形成肽键,同时给位上的tRNA脱落,3.转位(移位),反应需EFG, GTP, Mg2+参与 核蛋白体向mRNA 3端移动一个密码子的距离,受位进入一个新密码子,带肽键的tRNA由受位移至给位 肽键每增加一个氨基酸就按 进位成肽转位 这三步不断重复,直到肽链增长到必要的长度,OH,EFG,GTP,53,进位,成肽,转位,成肽,NC延长,转位(移位),四、肽链合成终止,需终止因子RF和IF3参与。终止信号出现,释放因子(release factor,RF)与其结合。RF有三种RF1,RF2,RF3,1.终止密码子的辨认,RF-1或RF-2,RF1和 RF2识别

14、终止密码,进入A位,H-OH,转肽酶,2. 肽链的水解和脱落,RF3使转肽酶变为水解作用,使P位上肽键与tRNA之间的酯键被水解分离。肽链自核蛋白体释出,3.tRNA、RF、mRNA的释放,核蛋白体大小亚基的解聚,OH,RF,GTP,RF,IF-3IF-1,在RF作用下,tRNA、核蛋白体自mRNA上脱落,在IF1作用下,核蛋白体分解为大、小亚基重新进入核蛋白体循环,1. 起始,2. 肽链延长,3. 终止,广义的核蛋白体循环,小 结,1合成方向:对mRNA的移动是自53肽链合成方向自N端C端2能量计算:活化与启动消耗2个高能键,生成一个肽键时需2个GTP,生成一个肽键的整个过程需4个高能键3核

15、蛋白体循环:在细胞内的翻译是以多个核蛋白体聚在一起的形式,一条mRNA上可同时合成多条同样的多肽。合成速度40aa/S,真核与原核蛋白质合成的异同,真核 原核 核蛋白体 80S 70S 含蛋白数量 多于80 少于60 小亚基结构 无嘧啶区和互补区 含嘧啶区与互补 tRNA tRNAmet tRNAfmet 启动 eIF 9-10种 需ATP 小亚基先与tRNA结合,在与mRNA结合延长 EF1,EF2 EFTu EFTs 终止 RF 需 GTP RF1,RF2,RF3,第三节 翻译后加工,合成后的多肽需经一定的加工,修饰或互相聚合才有活性 一、翻译后的加工修饰 二、分泌蛋白的跨膜转运,一、翻译

16、后的加工修饰,1. 多肽链的折叠,蛋白质二硫键异构酶(protein disulfide isomerase)和肽基脯氨酸异构酶(peptidyl prolyl isomerase)参与蛋白质的折叠过程。,前者能加速蛋白质正确二硫键的形成。后者则加速脯氨酸亚氨基肽键的顺-反异构化。,分子伴侣,一、翻译后的加工修饰,2. N端加工,原核生物,脱甲酰基酶,氨肽酶,真核细胞,一、翻译后的加工修饰,3. 氨基酸残基的修饰: 磷酸化、羟基化、乙酰化、糖基化4. 水解加工:酶前体的活化5. 亚基聚合:Hb 4亚基的聚合,蛋白质的定位,1.共翻译转移包括:分泌蛋白、质膜蛋白、溶酶体蛋白、内质网和高尔基体滞留

17、蛋白。2.翻译后转移核基因组编码的线粒体和叶绿体蛋白。,二、分泌蛋白的跨膜转运,将合成后的蛋白质,定向到达行使功能目标地的过程为跨膜转运 信号肽:使核蛋白体与内质网上的受体结合,合成的肽链进入内质网内腔运至靶器官,信号肽酶可切除信号肽,使成熟的蛋白质释放至胞外,信号肽结构,由被转运多肽链的N端约10-40多个氨基酸构成 。分三个区:N端为亲水区含碱性氨基酸, 提供正电荷中心疏水区含中性或疏水性氨基酸C末端是信号肽酶切割信号肽的部位,转运过程,(1)信号肽被信号肽识别粒子(SRP)结合,此时,多肽的合成就暂时停止或放慢;SRP把核蛋白体带至内质网膜的胞浆面与对接蛋白(停泊蛋白)结合,即核蛋白体与

18、内质网膜结合,新生肽链恢复延长。(2)信号肽被信号肽酶切割掉,蛋白质分泌到内质网腔,分泌蛋白的转运过程,蛋白质合成与医学的关系,一、分子病(molecular diseases)二、蛋白质合成的阻断剂 蛋白质生物合成自复制、转录和翻译的不同过程均有抑制剂能加以阻断。抑制剂包括抗菌素和毒素等,分子病,分子病:因DNA分子基因的缺陷,使某种蛋白质分子一级结构的氨基酸序列发生改变导致的遗传病。例:镰刀形红细胞贫血。病因:编码血红蛋白b链的基因,其DNA上的T被A代替,导致b链氨基端第6位的谷氨酸被缬氨酸代替,蛋白质合成的阻断剂,抗生素 1.四环素:抑制氨基酰-tRNA与原核细胞的小亚基结合 2.氯霉

19、素:与原核细胞的大亚基结合,对真核线立体合成有阻断作用 3.链霉素:与原核细胞30S核糖体结合,引起密码错读。白喉毒素:抑制哺乳类动物的延长因子EFT2的活性,蛋白质生物合成课堂练习下列为终止密码子 UCA B. UAA C. UGA UAG E. AUG下列是关于遗传密码的论述,错误的是低等生物和高等生物的遗传密码是不同的B. 遗传密码阅读的方向总是从mRNA的5 3方向阅读mRNA分子中的“三联体”时,相互间有标点符号隔开每种氨基酸都有2个或2个以上的密码子tRNA的1位反密码子与mRNA的3位密码子互补配对时,不完全符合碱基配对规则,3. 核糖体作为蛋白质合成的场所,其中的蛋白质至少 包括下列因子 A. 起始因子(IF) B. 延长因子(EF) C. 释放因子(RF) D. 因子 E. 因子4. 核糖体小亚基16SrRNA结合mRNA,主要是通过下列两个序列互补结合的 嘧啶碱序列与AUG序列 B. SD序列与嘌呤碱序列 C. 嘌呤碱序列与AUG序列 D. 嘧啶碱序列与SD序列 E. SD序列与UAA序列,

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