1、,第五章 化学中常用的计算机软件与网络资源,化学中的常用软件,分子结构绘图软件,科学计算和数据处理软件,文献管理,图谱解析,计算机辅助教学,量子化学计算,网络上的化学资源,化学化工综合网站,网上数据库,化学化工信息源,Internet上的免费专利资源,教育网内免费化学资源,Origin,ChemWindow,Chem office,5-1 化学中的常用软件,分子结构绘图软件,描绘化合物的结构式、化学反应方程式、化工流程图、 简单的实验装置图等化学常用的平面图形的绘制。,二维图形软件：,ChemDraw(Chemoffice), ChemWindow：商业软件http:/ http:/ 图例：,
2、ISIS Draw, ChemSketch：对教育界及家用为免费软件http:/ http:/ (Chemoffice) : 是ChemOffice的组成部分，同ChemDraw一起协同工作，ChemDraw上画出的二维结构式可以正确地自动转换为三维结构。 ultra版本还包括了一个很好的半经验量子化学计算程序MOPAC,能够以三维的方式显示量子化学计算结果。WebLab Viewer Pro, RasWin: Lite版只能显示而无法编辑三维分子模型，为免费软件 pro版本表现生物分子和晶体结构的能力比较强。 下载地址为http:/ frame), 球棍(ball and stick), C
3、PK及丝带(ribbon)等模式显示化合物的三维结构。,5-1 化学中的常用软件,wire frame ball and stick CPK,5-1 化学中的常用软件,WebLab Viewer,蛋白质和沸石分子筛晶胞显示图,5-1 化学中的常用软件,科学计算和数据处理软件,通用型：对实验数据进行数学处理、统计分析、傅里叶变换、t-试验、线性及非线性拟合；绘制二维及三维图形如：散点图、条形图、折线图、饼图、面积图、曲面图、等高线图等。 Origin： http:/ SigmaPlot： http:/ 化学中的常用软件,由Origin生成的二维及三维图形,5-1 化学中的常用软件,核磁数据处理软
4、件： NUTS：处理一维及二维核磁数据，其功能包括傅里叶变换、相位校正、差谱、模拟谱、匀场练习等几乎所有核磁仪器操作软件的功能，http:/ MestRe-C：处理一维核磁数据的免费软件。http:/qobrue.usc.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html,色谱及红外、Raman等实验数据的处理： GRAMS/32：http:/ 化学中的常用软件,文献管理,对文献进行整理，能在文字处理程序中直接插入参考文献并生成一定杂志规定格式的参考文献列表。,EndNote 4：http:/ Reference Manager 9.5, ProCite 5.0： http:/
5、 化学中的常用软件,图谱解析,核磁图谱： ChemNMR：ChemDraw Ultra版本的一个插件，可以用来估算大多数有机物的1H、13C化学位移及用线图表示的相应图谱。 C13 Module for ChemWindow：ChemWindow的一个插件，可以用来估算大多数有机物的13C化学位移。 gNMR：则可用来估算任何NMR活性核的化学位移，并能画出非常逼真的图谱http:/ Sparky ：二维核磁特别是对复杂2D NMR的解析。,5-1 化学中的常用软件,质谱 MassSpectra Simulator：http:/ ChemWindow 6.0 Spectroscopy版本,5-
6、1 化学中的常用软件,计算机辅助教学,CHAOS：有机合成路线设计 Organic Chemistry in Action，可以使用“逆序法”自动寻找目标物的合成原料。 ChemDraw ultra版，Beilstein公司的AutoNom 4.0版： 有机化合物命名工具命名软件，给出IUPAC名称，CAS名称，对立体化学的支持。http:/ Chemlab化学反应模拟软件 虚拟化学实验，交互式地仿真演示化学实验,FOR WIN9X。能够仿真大多数化学实验。CHEMLAB包含的东西非常多,滴定、反应动力学，周期表等。,5-1 化学中的常用软件,量子化学计算,WinMOPAC：半经验分子轨道(A
7、M1, PM3, MINDO, MNDO/3等)计算程序，计算出的分子轨道及电荷密度等可以用三维图形表示出来。http:/ Spartan：WaveFunction公司的产品，其计算方法包括：MM2, AM1, AM1 with Solvent, PM3, 从头计算等，亦可将分子轨道及电荷密度等用三维图形表示。http:/ 化学中的常用软件,用PC Spartan计算的丙烷的电子密度图,用HyperChem计算的甲醛的HOMO,5-1 化学中的常用软件,Gamess：免费的从头计算程序，其速度快，并提供源程序。 DOS界面。http:/www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GA
8、MESS.html。Gamess用户界面Visualize：http:/ Gaussian Client插件后简化用户的操作。http:/ HP, DEC)及LINUX操作系统的PC所设计的从头计算及密度泛函计算程序，其速度特快，用户界面一般。http:/ 化学中的常用软件,科学数据处理与绘图工具软件Origin, Origin的窗口组成, 数据的输入、编辑和保存, 数据的统计处理一元线性回归；多元线性回归；多项式回归, 数据关系的图形表示二维数据点；三维数据点,5-1 化学中的常用软件,科学数据处理与绘图工具软件Origin,5-1 化学中的常用软件,例1：现在某活性炭吸附甲醇的实验数据，将
9、其制成实验数据图。,（注：1mmHg=133.224Pa）,科学数据处理与绘图工具软件Origin,5-1 化学中的常用软件,例2,求此反应的速率常数。,有机分子结构式绘图软件ChemWindow, Chemwindow的窗口组成, 绘图工具栏简介, 附加库, 菜单命令, SymApps,5-1 化学中的常用软件,分子绘图及分子模拟计算软件Chemoffice,Chemoffice的组成ChemDraw ; Chem3D ; Chemfinder,ChemDraw核磁位移的估算,Chem3D提供三维分子结构显示、计算功能，并附带分子力学MM2程序，量子力学半经验MOPAC2000程序，提供了G
10、aussian接口。,5-1 化学中的常用软件,5-2 网络上的化学资源化学化工综合网站,中国化学化工信息资源：中科院化学所 http:/ ChemCenter；美国化学会ACS http:/www.chemcenter.org ChemWeb:虚拟化学俱乐部 http:/ 英国皇家化学会RSC及其ChemSoc http:/www.chemsoc.org Chemdex：英国Sheffied大学化学站点 http:/www.chemdex.org,Cambridgesoft：提供Internet上的化合物和化学反应在线数据库。 http:/; http:/ ChemFinder：提供Camb
11、ridgesoft公司的化学数据库检索服务。免费查询。 http:/ MDL Information Systems：在工业和科学界是公认生命科学和化学信息学的先导者。 http:/ Chemistry WebBook(http:/webbook.nist.gov/chemistry) PubMed(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed),5-2 网络上的化学资源网上数据库,化学化工信息源,文献：CA（http:/www.cas.org ）SCI：Web of Science (http:/ 国际纯粹与应用化学联合会IUPAC（http:/www.iupac.or
12、g ） 美国化学会（http:/www.acs.org ） 英国皇家化学会（http:/www.rsc.org ）,5-2 网络上的化学资源化学化工信息源,IBM知识产权网：http:/ 美国专利商标局Web 专利数据库：http:/www.uspto.gov/patft/index.html 欧洲专利局：http:/www.epo.co.at 中国专利数据库：http:/ 网络上的化学资源专利资源,教育网内免费化学资源(指定IP),Elsevier SPDOS China consortium：http:/ CNKI数据库检索系统全文数据库：http:/ Kluwer Online Journals:http:/,5-2 网络上的化学资源,
