1、昨天有人在群里问如何看一个结构几重穿插,我当时不太清楚如何用OLEX软件画出穿插的拓扑图,就告诉他用DIAMOND如何如何做.今天打开这个软件,捉摸了一下,好像做法和DIAMOND软件一样,现将操作过程演示一遍,也许很多地方大家会不甚明白,希望到时可以一起讨论!-倏忽2007-09-10 11:24,打开OLEX软件-导入数据,点Fragments按钮出现如上图-将下边两个复选框去勾(因为不是溶剂分子不参与骨架构筑,再点Fragments按钮下拉框,选generate钮,出现如上图 勾上link changeA from 最后边一个数可以选大点(如3or 4) 也可以选上remove hydr
2、ogens-OK,内容没有完全显示出来,可以点show view window -点fit to screen(右图上边最靠后的一个钮),出现如上图,再点show structure navigator(像一本摊开的书的形状的那个按钮)再看框里头atoms:之后的数字,如果数字相近且都很大的,就都选上,数字小的不要选,选上几个就说明有几重穿插),再点network-construct net出现如上图,再隐藏非NET键,步骤:点上边BONDnetwork bonds-将列出的键全选上如右图,再右点窗口图任意处,反选-invertion selection-再把这些选上的键删除,拓扑图都出来了,那几重穿插呢?,从结构里先选一个键再点fragments-properties-出现上图;再monochromatic处选一种自己喜欢的颜色,除了原来的红色还有粉红色的了-再从没有选过的键中再选一个键,如上方法,给其选另一种颜色,从上图中可以看出有三种颜色,就知道是三重穿插了,做完了,做得有点粗糙,但希望对各位兄弟姐妹有点帮助!,
