1、2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,1,外文医学数据库检索,主讲:马淮颖,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,2,第一节 Medline和PubMed一、Medline数据库 (96页)Medline数据库是美国国立医学图书馆创建和维护,是世界公认的最具代表性和最权威的生物医学书目数据库。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,3,Medline数据库收录范围收录70多个国家和地区的4600多种期刊,累积了1966年以来的1200多万篇文献记录,年收录量为40余万篇,其中80%为英文文献,80%含摘要。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,
2、4,Medline 涉及的学科范围Medline所收文献以文摘或题录混合方式报道。内容涉及基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理等领域。 该库每周更新。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,5,收录内容对应于三种印刷型检索工具: Index Medicus(医学索引)International Nursing Index(国际护理索引)Index to Dental Literature(牙科文献索引),Medline,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,6,Medline发展史1879年NLM出版IM,1964年N
3、LM开发了MEDLARS(医学文献分析与检索系统)1971年建成该系统的联机数据库Medline, 并投入联机检索服务;80年代Medline光盘问世,1997年6月,Medline网络版(pubmed)开始向因特网用户免费开放。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,7,二、PubMed概况,PubMed是NLM的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的生物医学文献检索系统,是继Medline国际联机检索和光盘检索之后推出的又一种网络检索形式。于97年6月在Internet上向用户提供免费检索服务。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,8,PubMed特点1、免费使用
4、,报道文献快,时效性强;2、收录范围广,检索途径多,查全率高;3、检索体系完备,具有强大的检索功能;4、与多家生物医学期刊出版商联合,通过链接可获取全文。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,9,PubMed 的网址:http:/www.PubMed.gov/http:/www.PubMed. com,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,10,1、 PubMed的文献来源 PubMed数据库是Medline数据库的扩充版,数据来源于4个方面: (1) Medline: PubMed的主要来源,每条记录末尾标有如下标记:PubMed-indexed for Medli
5、ne,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,11,(2) Oldmedline,收录66年以前的医学文献,记录中没有MeSH字段和摘要字段。记录末尾标记:PubMed-Oldmedline ,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,12,(3)PreMedline:,是Medline的前期数据库。收录正在等待标引的文献,其作用是缩短文献报道时差 。每天对数据进行更新,每周又把标引完整的记录转入Medline数据库,转入后的数据立即从 PreMedine中删除相应记录。Medline record in process,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,13
6、,(4) Publisher Supplied Citation出版商直接向PubMed提供的选择性的电子文献记录。不进入Medline每条记录末尾均标有:Record as supplied by publisher,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,14,三、PubMed字段和字段检索,(1)PubMed中的字段:PubMed中供显示和限定检索用的字段共60多个,其中主要字段有30多个。 (2)PubMed的字段限定检索:格式为:检索词字段标识符如:Cancer Researchta,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,15,四、PubMed的检索途径和方法,
7、PubMed主页有3个功能区:1.基本检索区:(简单检索)2.辅助检索区:3.专用检索区:(个性化检索),1、基本检索(简单检索),可对任何有实质意义的词进行检索: (1)词语检索 自动匹配功能 (2)精确检索 用“ ”进行强制短语检索 (3)截词检索 用通配符 ?,*检索 (4)逻辑组配检索 AND OR NOT (5)作者检索 (6)期刊检索,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,17,1、基本检索,(1)词语检索自动词语匹配功能:当未加任何限定修饰 的检索词被输入到检索提问框时,它们按照一定的顺序被核对、转换、匹配和检索。其目的是操作简单,并提高文献的查全率。匹配顺序如下:M
8、eSH转换表、刊名转换表、著者索引、,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,18,PubMed主界面,基本检索区,辅助检索区,专用检索区,一、基本检索,1.词语检索,自动匹配转换.,自动匹配转换功能,主题词索引 作者索引 期刊索引,自动匹配转换过程,.精确检索,一、基本检索,强制作为一 个词组检索,3.截词检索,一、基本检索,无限截词检索,3.截词检索,一、基本检索,有限截词检索,4.逻辑组配检索,一、基本检索,逻辑组配检索,一、基本检索,(2)用字段限定au检索,5.作者检索,一、基本检索,5.作者检索,(3)通过系统自动匹配功能自动检索,一、基本检索,6.期刊检索,(1)用字段
9、限定ta检索,一、基本检索,(2)通过系统自动匹配功能自动检索,6.期刊检索,一、基本检索,6.期刊检索,(4)通过“期刊数据库”检索,一、基本检索,6.期刊检索,一、基本检索,点击选中,发送至检索恇,6.期刊检索,一、基本检索,点击执行检索,6.期刊检索,一、基本检索,6.期刊检索,检索结果,二、辅助检索区,1. Limit (限定检索) 2. Preview/index(预览/索引) 3. History(检索史) 4. Clipborard(剪贴板) 5. Detail(检索式详览),作者限定,添加作者姓名输入框,清除限定,期刊限定,作者姓名索引选词,多作者逻辑匹配选项,全文、免费全文、
10、摘要限定,日期限定,1.Limit 对检索结果进行多重限定,出版日期限定,入库日期限定,研究对象 人/动物限定,性别限定,语种限定,子文档限定,文献类型限定,年龄限定,检索字段限定,执行检索,清除所有限定,2. Previw/index(检索策略预览),浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号 #1 OR #2) 浏览索引(index),检索预览,检索历史,索引加词检索,步骤3 索引选词,步骤4 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤2 输入待选词,步骤1 点击预览和索引,索引检索,检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child,3. History(检索史),检索历史回顾,检索式,检索时
11、间,检出篇数,检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#5 AND #6,用于暂时存放选中的文献,以备集中显示、打印或存盘。,4. Clipboard(剪贴板),检索时间,4.Clipboard(剪贴板),点击剪贴板显示被剪贴的内容,5.Details (匹配过程),显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词 如:liver cancer liver neoplasms 修改检索策略,显示数据库自动匹配转换过程,检索词转换,显示用户输入的检索式,检索明细,5.Details (匹配过程),三、个性化检索,1.MeSH Database 2.引文匹配器 3.临床问题,三、个性化检索,1
12、.MeSH Database 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词 例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?,MeSH Database 肾衰竭饮食疗法课题,1.输入检索词,3.点按规范词可获详细注解,2.执行浏览,主题词注释,可选副主题词,加权检索,不进行下位词扩检,该主题词所替代的非规范词形式,主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系,可选副主题词,选择检索,点击执行检索,检出结果更为专指,MeSH Database 检索的结果,2.引文匹配器 (Citation Matcher),Single citation matcher(单篇引文匹配器)查找特定文献进行补
13、缺,以查文献的准确信息。如查找:由Chang PY(taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者 Batch citation matcher(批引文匹配器),输入待检刊名,输入待检第一著者,特定文献查找(已知文献第一著者,欲查其他信息如其他著者等),得出其他著者,用于核对批量文献信息,插入文件,输入EMAIL地址,输入已知文献信息,3.临床问题(Clinical Queries),专门为临床医生设计的一种检索服务: Search by clinical study categoryFind systematic reviewsSpecial qu
14、eries,3.临床问题(Clinical Queries),用于临床问题的检索,3.临床问题(Clinical Queries),输入检索词,检索设置,3.临床问题(Clinical Queries),检索结果,检索结果输出,显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果,显示字段选择(Display),Abstract :来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 Summery:题录格式(标题、著者、出处) Citation : 显示上述内容外,加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 Medline: (最完整,有标识符),显
15、示格式选择,显示字段选择(Display),记录选择,单一记录:著者姓名 所有记录: 选定记录: 方框内打钩,输出格式选择(send to),选中题录(或文摘)后 Text:文本格式,用浏览器文件保存 File : 文件格式保存 Clipboad :暂存需下载记录,多项检索后一起保存。 最多允许存储500条,保留8小时。 Email:通过电子邮件发送 Other:全文传递服务等申请,需帐号、收费,获取原文及相关资源,1.联机获取原文( free full text article) 2. link out 3.向有关图书馆索要 4.其他数据库资源(生物信息学等),文摘中的期刊图标链接,Link
16、out链接,点击获取原文,检索实例,1.哮喘的药物治疗asthma/drug therapy 2.阿司匹林治疗心肌梗死#1 aspirin / therapeutic use #2 myocardial infarction/drug therapy#1 and #2,1.哮喘的药物治疗,选择MeSH Database 输入检索词(单词、词组) (不能输有运算符的语句如:asthma AND therapy),点击规范主题词,选择副主题词,选择检索,执行检索,检索结果 题录:著者、篇名、刊名,2.阿司匹林治疗心肌梗死,首先,将概念切分成2个面: Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗 然
17、后,分别进行规范词选择检索,第一个概念检出的文献,18885条记录,第二个概念进行主题词选择检索,第二个概念检出的结果18112条记录,在检索史中将2个检索式逻辑和组配(注意AND大写),逻辑和的检索结果 1003条记录,再进行限定检索,限定文献发表的时间,可以输入具体时间年、月、日,两个概念、2005年-2006年逻辑和检索结果77条记录,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,92,PubMed数据库实习题1、利用主题途径查近5年来“青少年肾功能衰竭的并发症或死亡率”临床实验(Clinical Trial)方面的全文文献(加权检索)肾功能衰竭 Renal failure 并 发 症 Complication死 亡 率 mortality,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,93,2、阿司匹林治疗心肌梗死#1 aspirin / therapeutic use #2 myocardial infarction/drug therapy #1 and #23、利用基本检索,查2002-2007年“婴幼儿维生素A缺乏(Vitamin A Deficiency)”方面的英文全文文献。,2018/11/1,复旦大学图书馆文献检索教研室,94,再见,