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Materials Studio帮助文件翻译.doc

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资源描述

1、欢迎欢迎使用 Materials StudioMaterials Studio 是一个采用服务器/客户机模式的软件环境,它为你的 PC 机带来世界最先进的材料模拟和建模技术。Materials Studio 使你能够容易地创建并研究分子模型或材料结构,使用极好的制图能力来显示结果。与其它标准 PC 软件整合的工具使得容易共享这些数据。Materials Studio 的服务器/客户机结构使得你的 Windows NT/2000/XP,Linux和 UNIX 服务器可以运行复杂的计算,并把结果直接返回你的桌面。Materials Studio 采用材料模拟中领先的十分有效并广泛应用的模拟方法。A

2、ccelrys 的多范围的软件结合成一个集量子力学、分子力学、介观模型、分析工具模拟和统计相关为一体容易使用的建模环境。卓越的建立结构和可视化能力和分析、显示科学数据的工具支持了这些技术。无论是使用高级的运算方法,还是简单地利用 Materials Studio 增强你的报告或演讲,你都可以感到自己是在用的一个优秀的世界级材料科学与化学计算软件系统。易用性与灵活性Materials Studio 可以在 Windows 98,Me,NT ,2000 和 XP 下运行。用户界面符合微软标准,你可以交互控制三维图形模型、通过简单的对话框建立运算任务并分析结果,这一切对 Windows 用户都很熟悉

3、。Materials Studio 的中心模块是 Materials Visualizer。它可以容易地建立和处理图形模型,包括有机无机晶体、高聚物、非晶态材料、表面和层状结构。Materials Visualizer 也管理、显示并分析文本、图形和表格格式的数据,支持与其它字处理、电子表格和演示软件的数据交换。Materials Studio 是一个模块化的环境。每种模块提供不同的结构确定、性质预测或模拟方法。你可以选择符合你要求的模块与 Materials Visualizer 组成一个无缝的环境。你也可以把 Materials Visualizer 作为一个单独的建模和分子图形的软件包来

4、运行。如果你安装了 Materials Studio 的其它模块,后台运算既可以运行在本机,也可以通过网络运行在远程主机上。这取决于你建立运算时的选择和运算要求。Materials Studio 的客户机/ 服务器模式支持服务器端运行在 Windows NT/2000/XP,Linux 或 UNIX 下,使得你可以最大化利用计算资源。效率和交流所以的研究人员都可以从 Materials Studio 强大功能中获益。这份文档的“演示”部分给出了一些简单的分子和材料的模型。这能使你获得对材料的更好的理解并能创建优秀的图形。与其它 Windows 软件的协同工作使得能容易地拷贝粘贴这些图形到其它文

5、档。结构和性质的数据能容易地从电子表格和数据库中导入导出。Materials Studio 帮助你显示和共享数据。 Materials Visualizer 也可以安装在研究部门、生产部门、工程部门和营销部门来在不同部门中共享工作。设计更好的材料Materials Visualizer 极大地提高了计算材料学的易用性。它在一个灵活易用的软件环境中为化学家、材料科学家和工程师带来了有力的方法。它使交流有关材料结构与性质和求解化学与材料工业中临界问题的观点变得简单直观。最近更新Materials Studio2.2 版更新许多的重要新特征出现在 Materials Studio2.2 版中,尤其发

6、布了增强的量子力学工具,新的介观模型模块,全新的经典模拟能量计算引擎,还有很多内部结构和核心 Materials Visualizer 功能的升级。新的产品MesoDyn。MesoDyn 是预测装软凝聚态物质介观结构动态组装,现在是 Materials Studio 的一个模块。Materials Studio 版本中的 MesoDyn 是对在 Cerius2 版本功能上的一个大的升级。MesoDyn现在能被用来解决形成动力学、自组装动力学和相界偏析等主要的工业问题,这些对高聚物、化学、电子、药物缓释、制药、生物技术和其它工业有重大意义。MesoDyn 的使用者第一次能在介观尺度上明确包括静电

7、作用建模。新的积分选项提供了对模板积分计算的显著改进。使用对称多处理器进行并行模拟也会提高性能。复杂的 volume visualization 选项允许用户创建 MesoDyn 预测的介观结构的极好的静态和动画图象。Forcite。Forcite 是 Materials Studio 中新的原子模拟工具,它可用于能量计算和分子与周期系统的几何优化。Forcite 采用全新的算法,可以调用 Dreiding、UFF(通用力场)和COMPASS 等力场。Forcite 优化周期系统时可以考虑对称性,这对检晶仪很有利。使用UFF 力场可以研究金属茂合物等无机系统。Forcite 仅在客户端使用。R

8、eflex。X-Cell ,一个新的粉末法索引工具,已被加入 Reflex 功能中,这是分子结晶学会发展的一个里程碑,代表了索引技术的一次飞跃发展。X-Cell 可以揭示粉末衍射图案蕴含的结构秘密,这已被证实用其它方法很难索引。X-Cell 在 2003 年 7 月发行。Reflex 的另一个革新是能和模拟的和试验的衍射图案一起独立显示出由 Pawley or Rietveld refinement 造成的背景贡献。Materials Studio 模块的提高Dmol3。此版本的 Dmol3 在 Windows 和 Linux IA32 系统中性能有 3-4提高。在所有平台上并行性能都有所提高

9、。这使 Dmol3 成为世界上最快的从头计算代码之一。新增的Handy-Tozer 功能使科学家能模拟氢键结合系统,获得准确的分子结构和热力学数据,这使得 Dmol3 成为制药业的一个很重要的工具。VAMP。作为 Accelrys 从头计算和分子动力学连接工具, VAMP 现在包含两个半经验方法MNDO/d 和 AM1*。 AM1*设计用来处理过渡金属元素。VAMP 在预筛选、fast geometry 过渡态搜索计算方面是一个优秀的工具,可用于均相催化等许多科研领域。附加的过渡态搜索功能使确定合适的过渡态搜索初始结构变得容易。CASTEP。使用最近建立的线性响应理论,CASTEP 现在有能力

10、计算声子频率。声子频率可用来显示声子散射曲线和声子密度状态,就像电子能带结构和状态点密度。另外,热力学量,如自由能和 Debye 温度也可以计算出来。这对 CASTEP 技术是一个很大的进步,开创了精确计算固体系统热力学性质的道路。通过计算 Mulliken charges,CASTEP 用户可以作 population analysis,包括每个角动量分量的 partial charges 和 Mulliken bond populations。PDP。PDP 现在支持运行 Tru64 UNIX 系统的 Compaq Alpha 服务器。Materials Visualizer 的改进队列系

11、统。Materials Studio 的所以模块都通过第三方队列软家支持串行工作提交。2.2版本支持一下队列:Generic NQS(Nwtwork Queuing System) ,3.50.9 版 http:/www.gnqs.org.OpenPbs(Portable Batch System) ,2.3.16 版 http:/www.openpbs.org.LSF( Load Sharing Facility) , http:/.注意:此版本的 Materials Studio 只在 SGI 计算机上运行 IRIX 操作系统时才支持NQS。除串行工作提交,Dmol 3、CASTEP 和

12、MesoDyn 支持运行 PBS Linux 架构的 MPI 并行工作和运行 PBS 或 LSF 的对称多处理器。但是,Windows 下 LSF 不支持 MPI 并行处理。我们计划支持其它的队列系统,以便定制其它方法的插件。电荷工具。Materials Visualizer 包含新的电荷工具,Gasteiger 和 Qeq。这些工具可以根据结合性和负电性给原子系统赋分数电荷。现在 Forcite 支持的 UFF 和 Dreiding 两个力场与电荷赋值方法无关。密堆积Materials Visualizer 包含新的测量和监视密堆积结果的工具。客户端自动存盘。客户端 Materials St

13、udio 添加了自动存盘功能。这可以减小客户端硬件错误造成的影响。Polymer builder。Polymer builder 已经提高了易用性。网关。本版本 Materials Studio 可以通过代理连到网关。平台改变Materials Studio 支持的平台有一下变化:CASTEP 和 Dmol3 现在支持 Intel Itanium 64 位处理器。所以 Materials Studio 模块都支持 Red Hat Linux 平台。除了 Dmol3、CASTEP 和Mesodyn 外,其它都要求安装 PBS。支持新的平台最新的 SGI IRIX6.5.15 和 6.5.16最新

14、版 Red Hat Linux7.3Red Hat Linux Advanced ServerRed Hat Linux 7.2 for Intel Itanium不再支持的平台Windows NT Workstation 4.0 SP4 and SP5Windows NT Server 4.0 SP4 and SP5Windows NT Server, Enterprise Edition 4.0 SP4 and SP5SGI IRIX 6.5.4 to 6.5.9Red Hat Linux 6.2 and 7.0, and 7.1系统库文件变化对于 IRIX 系统,从以前版本 Materi

15、als Studio 升级时需要 SCSL Scientific Library 3.5。Materials Studio 安装光盘包含这个完整的库文件,但必须单独安装。硬件要求变化客户端最低 CPU 要求为 Intel Pentium II 或兼容处理器。许可改变在 Windows 和 UNIX 下。最新版的 Accelrys License Pack5.2 版,都会作为Materials Studio 安装过程的一部分自动安装。安装过程中检测到的先前版本的 License Pack会自动升级到最新版。从 Materials Studio 2.1 开始,Accelrys License Pa

16、ck 用来管理 Materials Studio 的许可。由于这种提高,在 UNIX 和 Windows 平台下,你可以和 Accerlys 其它使用 License Pack 的产品共享许可,这些产品包括 Discover Studio、Cerius 2、Insight Materials Studio 简介Materials Studio 特点Materials Studio 有一系列适合材料建模特点。Materials Visualizer 为 Materials Studio 提供了核心的建模能力和软件基础。Materials Visualizer 包括以下特点:模型三维可视化,有很多

17、显示样式、参数和测量工具。草画和编辑分子模型,包括金属有机化合物。构造晶体。构造高聚物。构造表面、层、真空板状结构。分子和周期系统的对称性寻找及编辑工具。图形、图表和电子表格形式显示数据。使用 Materials Studio 工程进行数据处理。高质量打印输出。管理监视服务器计算工作的工具。另外还有集成到 Materials Studio 中的独立产品,它们建成了一个范围广泛的材料建模工具。Amorphous Cell非晶态材料的建模和性质预测,尤其适于高聚物、有机液体和它们的混合物。CASTEP适用于固体材料的基于量子力学的第一原理平面波赝势软件。客户机/服务器结构注意。如果你要安装除 Ma

18、terials Visualizer 以外的 Materials Studio 产品,必须阅读这段。什么是客户机/服务器客户机组件,如 Materials Visualizer,请求服务器组件,如 Discover,作一些计算。当计算完成或达到一定的进度,结果从服务器传到客户机。客户机和服务器并不一定在同一台电脑上运行。Materials Studio 客户机/服务器结构怎样工作的?Materials Studio 使用了称之为 Disconnected Server 结构(DSA) ,DSA 使用 HTTP 协议在客户机/服务器间传递信息,就是运作 Web 的技术。客户机/服务器间的信息传递

19、由称为网关的软件处理,它安装在服务器端。网关接受客户机的工作提交并传给安装在服务器上的代码,然后计算就开始了。网关也向客户机报告计算进度和结构。你可以在任何电脑上建立网关,无论是 UNIX,Windows 还是 Linux,在任何你喜欢的服务器上进行计算,如果 Materials Studio 服务器相关组件安装在那台电脑上。从客户机上很容易安装网关。如果有一台 PC 运行 Windows NT,2000 或者 XP 操作系统,你就可以在同一台电脑上运行客户程序和服务程序。下表列出了客户机和服务器在不同操作系统下的要求:Clients ServersWindows 98Windows Mill

20、ennium (Me)Windows NT Workstation 4.0 - SP6aWindows 2000 Professional - Retail, SP1 and SP2Windows XP Home EditionWindows XP ProfessionalWindows NT Workstation 4.0 - SP6aWindows NT Server 4.0 - SP6aWindows 2000 Professional, Server, Advanced Server - Retail, SP1 and SP2Windows XP Home EditionWindows

21、 XP ProfessionalCompaq ES/GS AlphaServers running Tru64 4.0F, 4.0G, 5.1 or 5.1ASGI IRIX - 6.5.10 -6.5.16Red Hat Linux - 7.2 and 7.3 (Intel compatible)注意:Materials Studio 2.2 不再支持 Red Hat Linux 6.2 和 7.1,只支持 Red Hat Linux 7.2 和 7.3。通过 Materials Studio 客户机/服务器结构,你可以从 PC 客户端向专用的 Windows NT/2000/XP、UNIX

22、 或 Linux 服务器提交计算。工作可以在不连接模式下计算,这样他们与你 PC 上的资源无关。你可以在 PC 上注销,工作照样在服务器上运行。当你重新在 PC上登录时,你可以看到计算进度或结果。这些计算也可以在运行 Windows NT/2000/XP 的计算机上本机运行。客户机可以在任务运行时和它传递信息。例如在分子动力学模拟过程中,模型和图形可以动态更新,Discover 发送回来的信息可以显示在文本文件中。你可以按自己需要选择这些的结合。任务和服务器状态状态都可以浏览。Materials Studio 在哪里计算?Materials Studio 不同模块计算需要的资源不同。计算可以分

23、为两大类来考虑:A 类这些计算只需要很短的时间和很少的计算资源,它们并不经过网关或客户机/服务器结构。这类模块一直安装在客户端电脑里。B 类这类计算需要很长的时间和很多的计算资源,自然它们运行在专用的服务器上。它们以任务来运行,使用网关,由客户机/服务器结构控制。这类模块安装在运行UNIX/Linux 或 Windows NT/2000/XP 的服务器上。下表总结了此版 Materials Studio 每个模块所属计算种类和操作系统要求。Module Category Windows 98 Windows Me Windows NT Windows 2000 Windows XP Tru64

24、 UNIX IRIX Red Hat LinuxMaterials Visualizer N/A 支持 支持 支持 支持 支持 Amorphous Cell B 支持 支持 支持 支持 支持 支持CASTEP B 支持 支持 支持 支持 支持 支持COMPASS B 支持 支持 支持 支持 支持 支持Discover B 支持 支持 支持 支持 支持 支持DMol3 B 支持 支持 支持 支持 支持 支持DPD B 支持 支持 支持 支持 支持 支持Equilibria B 支持 支持 支持 支持 支持 支持Forcite A 支持 支持 支持 支持 支持 MesoDyn B ?/center

25、 ?/center ?/center ?/center ?/center ?/centerReflex A1,2 ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/centerReflex Plus B ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/centerVAMP A1 ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center ?/center1 VAMP 和 Reflex 的 Power In

26、dexing 组件只能以 B 类计算通过网关进行。2 X-Cell 只能以 B 类计算通过网关进行。Materials VisualizerMaterials Visualizer 是 Materials Studio 的核心模块,提供建模、分析和可视化的工具。清晰直观的用户界面提供了高质量的 Windows 标准环境,你可以添加任何其它的 Materials Studio 模块。Materials Visualizer 提供了快速直观的工具,使你能构造分子、晶体材料、表面、界面、层结构和高聚物的图形模型。你能操纵、查看并分析这些模型。Materials Visualizer 也处理图表、表格

27、和文本数据,提供软件基础和分析工具,以支持所以的 Materials Studio 产品。Materials Visualizer 也可以单独运行,来建立、显示和编辑结构。和其它 Windows 软件交换数据是你轻易共享和报告结构和数据。获得 Materials Visualizer 帮助Materials Visualizer 的帮助是 Materials Studio 在线帮助的核心部分,在所有 Materials Studio 安装中都有。Amorphous CellAmorphous Cell 是建立复杂无定型系统代表性模型并预测主要性质的一套计算工具。你能预测并研究的性质包括内聚能密

28、度、状态方程行为、链堆砌和局部链运动。Amorphous Cell 创建结构采用的方法是基于很好建立的产生包含链分子的疏松无序系统包含真实平衡构象。其它的特点有建立包含小分子和高聚物任意比例混合的系统、产生有序向列相中间相和无定型材料厚板的专门功能,这适合于创建界面模型,用于研究粘着和润滑。获得 Amorphous Cell 帮助Amorphous Cell 是一个模块,你可以购买安装进 Materials Studio。如果你已经安装了Amorphous Cell,Materials Studio 在线帮助的目录栏会出现有关 Amorphous 的帮助。CASTEPCASTEP 最先由英国剑

29、桥大学凝聚态理论小组开发,它采用密度泛函理论模拟很大一类材料固体、界面和表面的性质。CASTEP 基于总能量的平面波赝势理论,运用原子数目和种类来预测包括晶格参数、分子对称性、结构性质、能带结构、固态密度、电荷密度和波函数、光学性质。高效并行版本可以模拟包含数百原子的大系统。获得 CASTEP 帮助CASTEP 是一个模块,你可以购买安装到 Materials Studio 中。如果你已经安装了CASTEP,Materials Studio 的在线帮助目录中包括 CASTEP 的部分。Dmol3Dmol3 是独特的密度泛函理论量子力学软件,可以研究气相、溶液、表面和固体系统。由于它独特的静电学

30、近似,Dmol3 一直是最快的分子密度泛函计算方法之一,使用非局域化的分子内坐标,可以快速优化分子和固体系统的结构。使用 LST/QST 算法和共扼梯度结合,Dmol3 可以有效地搜索过渡态,避免了耗时的黑塞矩阵的计算。过渡态搜索功能可以应用于分子和周期系统。获得 Dmol3 帮助Dmol3 是和 Materials Studio 集成在一起的。一旦你安装了 Dmol3,Materials Studio 在线帮助目录栏就包含 Dmol3 帮助的部分。PDP耗散系统粒子动力学(PDP)是动态模拟包含完备流体动力学相互作用的流体粒子。潜在的粒状粗糙性使得模拟跨越了传统分子模拟所达不到的长度和时间(

31、在相同硬件上) 。Materials Studio 中的 PDP 的实现包括了由原子模拟继承来的输入参数的详细指令。从更详细的输入模拟中引出输入数据意味着系统潜在的化学性质没有丢掉,而是明确地包含在PDP 运行中。PDP 采用周期性边界条件来有效模拟无限系统。封闭效应可以通过使用二维板观察出。LeesEdwards 边界条件可以用来模拟剪切系统。表面张力和临界胶束凝聚(critical micellar concentration )的性质也能获得,还有大量的可视化和数字输出。获得 PDP 帮助PDP 是一个模块,你可以购买并安装到 Materials Studio 环境中,如果你安装了PDP

32、,Materials Studio 的在线帮助目录栏中会包含 PDP 帮助部分。DiscoverDiscover 提供了功能强大的原子模拟方法,适用于很大范围的分子和材料。Discover是 Materials Studio 的“模拟引擎” 。它集成了很大范围已被证明适用于分子设计的分子力学和动力学方法。它使用精心设计的经验力场作为基础,可以有把握的计算最小能量构象、分子系统一系列构象和动态轨道。Discover 为 Amorphous Cell 等模块提供了计算基础。周期性边界条件可以用来模拟固态材料,无论是晶态还是无定型态或者是溶液。包罗万象的分析特点使得能够提取模拟的相关结构。获得 Di

33、scover 的帮助EuilibriaEuilibria 是用于确定有机分子和高聚物相图的强大模块。Equilibria 使用基于吉布斯系综的蒙特卡诺模拟发为基础。这套工具可以计算纯组元在给定温度下汽液共存点、二元和三元系在任意给定温度和压强下汽液或液液共存点。临界常数工具可以根据补充的一系列纯组元的共存点预测临界点。使用这个强大的工具,依据 Ising scaling law,从相图上已知的几个共存点就可以获得纯组元系统完整的相图。它也有计算任意给定温度下小分子的第二维里系数的功能。由于 Euilibria 完全集成在 Materials Studio 建模环境中,用户可以采用一下合理的模拟

34、过程:首先画出组成分子自身,建立无定型原胞,接着进行蒙特卡诺模拟,最后计算完整相图。获得 Equilibria 帮助ForciteForcite 是分子力学模块,可以使用经典力学对任意分子和周期系统进行势能和几何优化计算。Forcite 支持 COMPASS、UFF 和 Dreiding 力场。藉由力场的广泛性,Forcite 原则上能处理任何材料。几何优化算法提供了最速下降发、共扼梯度发、准牛顿发和完全牛顿Rhapson 发,还提供了连续使用这些方法的灵巧方法。这使得可以准确地进行能量最小化计算。获得 Dorcite 帮助MesoDynMesoDyn 一直是研究大系统介观尺度的动态方法。这种

35、算法动态地跟踪由化学势梯度和 Langevin 噪音造成地组元密度场变化。系统不同组元间通过计算的能量或者Flory Huggins 参数的有效势来相互作用。它是牺牲原子水平上的细节换取大系统和长时间的。MesoDyn 可以容易地研究微相分凝(microphase separation) 、胶束偏聚(micellar aggregation)和自组装等现象。确定几何行状地剪切和限制效应也可以研究。MessDyn 的应用包括:油漆和乳液、化妆品和其它个人用品、金属高聚物混合材料、表面活性剂的溶解、复杂药物缓释物质和很多其它方面。获得 MesoDyn 帮助ReflexReflex 提供快速交互的粉

36、末衍射数据模拟。使用 Power Diffraction 工具,模拟结构以图形显示,便于理解。模拟结构可以直接和试验数据比较。模拟结果可以在结构改变后立即更新,以便和试验结构实时比较。可以进行 X 射线、中子和电子衍射模拟。Power Index 工具可以自动或手动寻峰,使用 TREOR90、DICVOL91 、ITO15 或最新的 XCell 程序索引并自动确定空间群。XCell 是一个单独授权的工具,可以安装在Reflex 模块中。Power Refinement 工具运行你修改 Pawley refinement 和 Reitveld Refinement 来最优化粉末衍射模拟参数和晶体

37、结构以便使模拟结果和试验结果尽可能一致。改变诸如衍射性质、辐射种类、配置函数和试样参数等变量是直接通过 Materials Studio 对话框进行的。获得 Reflex 帮助Reflex PlusReflex Plus 是 Reflex 的高级版本,在标准 Reflex 功能上加入了有效的粉末衍射结构分析技术。它提供了从高质量粉末衍射数据中确定晶体结构的完整功能。Power Solver 的方法:Reflex Power Indexing 工具根据试验的粉末衍射图案索引确定晶胞参数和所属晶类。在 Reflex Power Refinement 模块中的改进的 Pawley 程序精修晶胞参数、

38、峰行状和背景参数,它也是减小可能所属空间群的有用工具。Power Solve 方法搜索晶胞中可能的原子分子排列。它找到模拟结构尽可能与试验结构接近的结构。最后的结果精修由 Reflex 中的 rigidbody Rietveld Refinement 功能完成。获得 Reflex Plus 帮助VAMPVAMP 是一个艺术级的半经验量子力学程序,用于模拟气相和溶液中的反应和性质。此程序已被优化的高度数值稳定和快速,即使对大分子系统的计算也十分有效。VAMP 在几何和过渡态优化和静电学方面有很大改进。它可以模拟溶解作用,计算偶极矩、极化率、电荷密度、静电势、热力学性质和 13C 化学位移等性质。

39、获得 VAMP 帮助VAMP 完全集成在 Materials Studio 环境中。你一旦安装了 VAMP,Materais Studio 在线帮助目录栏会有 VAMP 帮助部分。COMPASSCOMPASS 是支持凝聚态材料原子级模拟的功能强大的力场。COMPASS 代表Condensed-phase Optimized Molecular Potentials for Atomistic Simulation Studies(原子模拟研究的凝聚态优化分子势场) 。COMPASS 是第一个参数化和被凝聚态性质验证了的从头计算力场,并加入了多种孤立系统模拟用的从头计算和经验的数据。因此,这种力

40、场能精确同时预测在很大温度和压强范围内,很多种孤立系和凝聚态分子的结构、构象、振动和热力学性质。COMPASS 最近的改进在参数化了 45 种无机氧化物材料和包含有机无机材料混合系统界面。COMPASS 是一个独立的产品,你可以购买并安装进 Materials Studio。进一步信息你可以在 Accelrys 站点获得有关 COMPASS 的进一步信息。COMPASS Contents(需要密码)本地化Materials Studio 能识别并正确处理不同地区的数据格式约定。例如:Materials Studio运行在配置为英语地区的 PC 上能正确地把 1,000 解释为 “一千” 。但是

41、,如果配置为德国地区,Materials Studio 把 1,000 解释为“一点零零零” 。一个例外是:由 Materials Studio 用户界口和服务程序产生的大多数文本文件和超文本文件总是以英语约定习惯显示在屏幕上,而不管当前地区。这些显示是只读的,不会破坏原来数据。注意:演示部分的数据是以美国英语格式显示。如果你的系统配置为其它地区,在输入数据前请转换为当时格式。例如,如果系统配置为德国地区,演示部分要输入 5,000(五千) ,你应该键入 5.000 。印刷上的约定Materials Studio 帮助使用以下印刷上的约定。描述界面元素的字用斜体。例如:选择 File | Pr

42、inter setup,然后单击 Landscape你键入的字用蓝色。例如:键入 180,并按回车。到帮助系统之外的链接,如到互联网 URL 的链接,前有一个图片。例如:Accelrys Materials Studio homepage链接会在一个新的浏览器窗口中打开。Accelrys 信息资源 提供有关 Accelrys 公司的全部新闻和信息。 Accerys 公司有关材料科学的全部产品和商业活动,包括产品细节、最新产品、应用领域的背景信息、客户学习和 Accelrys 公司的科学合作细节。 为 Accelrys 产品用户提供广泛的信息,包括常见问题的回答、获得支持的细节、用户组织和会议的

43、信息和只对合作伙伴开放需要密码的资料。www.materials- 提供 Accelrys 站点与 Materials Studio 有关的所有产品和支持的快捷方式。其它信息资源Accelrys 的发起者 MatHub,是网上计算材料科学的焦点。MatHub 由两部分组成引用页和一本杂志。引用页包括了材料建模和材料信息的背景信息、分子建模的历史、计算技术采用的理论的有关解释和建模在工业和教育上的应用的信息。也有其它的链接、软件、科学引文。杂志刊出观点、评注和计算材料科学有关的当前信息。Materials Studio 界面Materials Studio Visualizer 是符合微软标准的

44、应用程序。它包含很多和其它微软产品相似的用户接口界面元素。其余的符合微软标准,但为 Materials Studio 所特有。下面显示了 Materials Studio 界面。 Menus 提供有关 Visualizer 的命令 Modules Menu 提供了调用模块的功能。模块可以单独购买,能增加 Materials Studio 的功能。 Toolbars 提供调用模块和其它常用命令的快捷方式。 Properties Explorer 是查看和编辑对象属性的接口。 Project Explore 用来查看和处理属于 Materials Studio 工程的文档。 Job Explore

45、 可以便利地查看工程任务,你可以查看并处理它们。 Visualizer 底部的状态条显示有用提示和耗时操作的进度。 Documents 包含用来建模的数据。 3D Visualizer 提供三维模型文档的三维视图。这对显示和处理原子和介观尺度结构是很重要的。 Chart Viewers 提供图形文档的视图,一般用来显示二维 x-y 坐标轴的数据。 Grid Viewers 显示表格文档视图,它是标准的电子表格的接口。 Text Viewer 显示简单文本文件和复杂的超文本文件。 对话框包含显示详细的选项的控件。 鼠标广泛的用来交互控制文档。 超文本帮助为你使用 Materials Studio

46、 提供详细的帮助 信息对话框警告错误发生或要求详细信息。文档Materials Studio 使用文档建模时创建和处理的数据。实际上,建模可被看作创建和编辑 Materials Studio 文档的过程。Materials Studio 文档可以通过导入很多标准格式创建,也可以使用 Materials Studio 自己的格式创建和保存文档。文档可以显示在相关的察看窗口或工程浏览窗口中。文档可以使用拷贝和粘贴与其它程序交互数据。现在 Materials Studio 使用一下四种不同的文档格式: 3D 模型文档保存原子分子结构。 文本文档保存纯文本或 HTML 文件。 图形文档保存数值结构和分

47、析。 表格文档包含表格数据。三维模型文档三维模型文档用来描述 Materials Studio 中的三维结构。三维模型文档,在三维视图中显示的靛蓝晶体结构Materials Studio 中三维模型文档有四种不同类别: 三维原子文档:包含诸如有机分子、高聚物、有机金属化合物、框架结构和分子晶体等的原子结构。你可以使用 Materials Visualizer 中的 atomistic building tools创建三维原子文档。 三维原子动画:包含一系列相关的原子结构或框架。原子动画可以用 Animation工具条的动画按钮控制放映。 三维介观文档:包含介观结构。你可以在 Materials

48、 Studio 中创建空的三维介观文档,然后使用文件编辑工具从已存在的三维介观文档中拷贝内容。这些工具在Edit 菜单和 Standard 工具条。注意:不能在三维原子文档和三维介观文档之间拷贝粘贴。 三维介观动画:包含一系列的相关结构结构或框架。三维介观动画可以使用Animation 工具条中的按钮控制播放。所有的三维文档都可以包含 volumetic data,如电荷密度和等值面等。它们一般在 3D Viewer 中显示。文本文档Materials Studio 中文本文档包含纯文本或超文本。它们用 Text Viewer 显示。文本文档,用 Text Viewer 显示的靛蓝粉末衍射指标

49、结果。图形文档图形文档包含二维数值数据,如 Materials Studio 产生的结果和导入的试验数据等。它们用 Chart Viewer 显示。图形文档,Chart Viewer 显示的靛蓝粉末衍射数据。表格文档Materials Studio 中表格文档存储表格数据。它们以 Grid Viewer 显示为电子表格的形式。表格文档,Grid Viewer 显示的靛蓝的粉末索引数据。查看器Materials Studio 包括几种查看器。每种是用来显示 Materails Studio 中一种文档。Materails Studio 中包括以下几种查看器: 3D Viewer Chart Viewer Grid Viewer Text Viewer3D Viewer3D Viewer 高质量地重现创建或导入 Materials Studio 中的三维模型文档。使用 Materials St

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