1、氨基酸及其衍生物按照 -氨基酸中侧链 R 基的极性性质，组成蛋白质的 20 种常见氨基酸可分 4 组：R 基为非极性的氨基酸。共有 8 种，5 种带有脂肪族侧链，即丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸和脯氨酸，2 种为芳香族氨基酸，即苯丙氨酸和色氨酸，一种为含硫氨基酸，即甲硫氨酸;本组氨基酸在水中的溶解度比极性 R 基氨基酸小 ;脯氨酸与一般 -氨基酸不同，它是 -氨基酸上的侧链取代了氨基酸上的一个氢原子所形成的，实际上是亚氨基酸。R 基有极性但不具有电荷的氨基酸。共有 7 种，即 R 基有羟基的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸，R 基有巯基的半胱氨酸，R 基有酰胺基的谷氨酰胺和天冬酰胺，另一种氨基酸为甘氨
2、酸; 甘氨酸分子无 R 基，但具有一定的极性，故归于本组 ; 本组氨基酸侧链中含有不解离的极性基，能与水形成氢键，较易溶于水。R 基带正电荷的氨基酸。共有 3 种，即赖氨酸、精氨酸和组氨酸; 在 pH7.0 时携带正电荷，也称碱性氨基酸。R 基为带负电荷的氨基酸。共有 2 种，即谷氨酸和天冬氨酸; 在 pH7.0 时分子带负电荷，也称酸性氨基酸。20 种氨基酸的结构式，缩写符号和有关常数见表。除上述 20 种常见的氨基酸外，尚有二碘酪氨酸、甲状腺素、羟脯氨酸、羟赖氨酸等见于某些蛋白质中。除了参与蛋白质组成的氨基酸外，还在各种组织和细胞中找到 200 多种其他氨基酸，这些氨基酸大多是组成蛋白质的
3、那些 -氨基酸的衍生物。但是，有一些是 -、-或 -氨基酸，并且有些是 D 型的氨基酸，如 -丙氨酸、-氨基丁酸以及在抗生素短杆菌肽 -S 中的苯丙氨酸、革兰阳性细菌细胞壁中的 D-丙氨酸和 D-谷氨酸。有些非蛋白氨基酸在代谢上作为重要的前体或中间产物，其中 -丙氨酸是维生素泛酸的前体，瓜氨酸及鸟氨酸是合成精氨酸的前体，-氨基丁酸是神经传导的化学物质。植物含有非常多的非蛋白氨基酸，属于植物次生物质，如茶氨酸、南氨酸、刀豆氨酸、黎豆氨酸和 -氰丙氨酸等。甘氨酸，丙氨酸，脯氨酸小，非极性侧链都弱疏水性。苯丙氨酸，缬氨酸，亮氨酸，异亮氨酸，蛋氨酸有较大的侧链，更强烈的疏水性。极性不带电侧链也有八种氨基酸与极性不带电的侧链。丝氨酸和苏氨酸的羟基。天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基团。组氨酸和色氨酸的杂环芳族胺的侧链。半胱氨酸有巯组。酪氨酸酚侧链中。半胱氨酸的巯基，酚性羟基，酪氨酸，组氨酸的咪唑基都显示出某种程度的 pH 依赖性离子化。有四个与带电侧链的氨基酸的侧链。天门冬氨酸和谷氨酸有其侧链上的羧基基团。，每个酸是完全电离的在 pH 7.4。精氨酸和赖氨酸侧链氨基。其侧链完全质子化在 pH 7.4 此表显示了氨基酸名，三和一个字母的标准缩写，和线性结构。点击氨基酸名称费歇尔投影式（以粗体显示的原子相互键合）。
