1、RNA互作，靶基因预测，定位以及疾病分析数据库,RNA互作、定位、疾病数据库,互作,定位,疾病,*RAID2.0中有这两个数据库的部分数据整合在其中，同时也在更新计划中，有需要可以关注。,Refernce,RAID v2.0：RNA-RNA、RNA-Protein互作模式，http:/www.rna-society.org/raid/ RNALocate ：RNA的亚细胞定位数据库，http:/www.rna-society.org/rnalocate/ MNDR v2.0：非编码RNA与疾病的数据库，http:/www.rna-society.org/mndr/ Reference RAID
2、 v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118. RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138. MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mamma
3、ls. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,RAID v2.0RNA-RNA、RNA-Protein互作http:/www.rna-society.org/raid/,RAID v2.0数据展示,RAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118.,RAID v2.0共包含mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA、tRNA
4、等10余种类型，超过527万条数据。 可通过主页上的“Statistics”点击进入查看数据分布情况。,850倍RNA相关互作；与实验或计算预测证据相结合；基于综合置信度评分进行可靠性评估；物种覆盖率提高到60。,RAID v2.0页面展示,搜索与浏览，侧重点各有不同，我们分别展示。,可根据note选择搜索关键词,在Download的数据表中会看到简写为S/W/P。,以hsa-miR-34a-5p为例搜索,精确匹配选项,来看看hsa-miR-34a-5p的朋友圈,再看个与蛋白质互作的！,搜索框内输入MALAT1，将打分限定为0.9-1.0后进行搜索。然后“more”一下。,可查看与蛋白质结合的
5、序列,可根据互作类型、检测方法或物种进行浏览，这里以RNA-Protein互作为例。,您能浏览到的,艾玛，请宽恕我越来越小的截屏字体，相信总有一款适合您 。,关于下载，不赘述，后面还有！,分体与合体的区别,RNALocateRNA的亚细胞定位数据库http:/www.rna-society.org/rnalocate/,RNALocate是如何构成的？,RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138.,可搜索可浏览，内容丰富，展示直观
6、,可根据定位、组织和RNA类型浏览,以定位浏览为例，左右均可以点选,直达NCBI链接,搜索功能都能获得什么？,序列展示与浏览功能类似,同源展示，可进一步追踪,一步邻居？两步邻居？请选择您的网络展示形式,看不清？任性调！,本站数据有三种基础下载形式可选,怕不怕？,MNDR v2.0非编码RNA与疾病的数据库http:/www.rna-society.org/mndr/,MNDR v2.0看得到的有什么？,如果您有目标RNA，想知道它和什么疾病相关,如果您研究某种疾病，想知道有哪些RNA与之有关,MNDR v2.0看不到的有什么？,MNDR v2.0: an updated resource of
7、 ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,MNDR v2.0中您更关心什么？,MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,如何使用MNDR v2.0搜索？,1,2,3,4,5,6,7,8,搜索结果展示,搜索结果“more”细节展示,如何使用MNDR v2.0浏览？
8、,查询非编码RNA和疾病的关系，可根据疾病、非编码RNA和物种浏览,点击想要浏览的疾病，可以直接看到相关的非编码RNA,也可下载后查看,关于Download,下载后的文件以“.TXT” 记事本形式存在，直接查看不方便，可以转到excel表格中。,上一页浏览到的43条信息，均在下载的数据表中。,S:强验证；W:弱验证；,当然还有整体的Download,关于Statistics,哈哈哈哈哈！：,请原谅我的不成熟，这几个饼图我玩了至少有5分钟，上面的饼图可以点，下面图例的小圆点也是可以点的，然后我就看着饼图切换来切换去咳咳！我就不上图了，您可以自己体验,Help! Help! Help is here!,北京博奥晶典生物技术有限公司,业晶于勤,术典于芯,
