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nimblegen芯片定制表格 定制设计包括两种:表达谱芯片设计、tiling芯片.docx

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1、博 奥 生 物 有 限 公 司生 物 芯 片 北 京 国 家 工 程 研 究 中 心北京市昌平区生命科学园路 18 号邮编:102206电话:86-10-80726868 传真: 86-10-80726898网址:http:/NimbleGen 芯片定制表格定制设计包括两种:表达谱芯片设计、Tiling 芯片设计(包括 CGH、ChIP-chip、甲基化等) 。- 定制表达谱芯片请填写 SectionA 和 SectionC;- 定制 Tiling 芯片请填写 SectionB 和 SectionC;提示:为了保证定制设计的准确性和可靠性,请认真填写下面的表格Section A1、请对定制设计

2、进行扼要描述(例如: whole-genome expression array for Human)2、请指定探针设计所用数据库名称及网络链接(例如:RefSeq-release40,ftp:/ftp.ncbi.nih.gov/refseq/)注:建议选择质量较好并且有注释的数据库,例如: GenBank: http:/www.ncbi.nih.gov/Genbank/ RefSeq at NCBI: http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq UCSC Genome Collection: http:/genome.ucsc.edu TIGR Gene Index

3、Collections: http:/tigr.org/tdb/tgi/3、如果您需要直接提交序列信息,请参照以下几种格式提交附件(双击下面黄色区域可打开模板文件): Tab-delimited ASCII tables 博 奥 生 物 有 限 公 司生 物 芯 片 北 京 国 家 工 程 研 究 中 心北京市昌平区生命科学园路 18 号邮编:102206电话:86-10-80726868 传真: 86-10-80726898网址:http:/NC_004325_Tab_delimited_ASCII.txt Annotated sequences in GenBank formatNC_00

4、4325.gbk FASTA format (acceptable only for clustered EST designs) NC_004325_fasta_format.txtSection B1、请对定制设计进行扼要描述(例如 ChIP-chip design for human chromosome 4.)2、请指定探针设计所用数据库名称及网络链接3、请填写探针设计所针对的物种及数据库版本、并提交表格指定所需要 tiling 的区域(包括染色体起始位置) 、探针重复数、正负链Organism (如 Homo sapiens):_Build (如 hg18):_请参照模板文件格式提交

5、附件(双击下面黄色区域即可打开模板文件):custom_tiling_coordinates.xlsSection C1、芯片上是否需要其他的对照序列或探针: 是 否博 奥 生 物 有 限 公 司生 物 芯 片 北 京 国 家 工 程 研 究 中 心北京市昌平区生命科学园路 18 号邮编:102206电话:86-10-80726868 传真: 86-10-80726898网址:http:/如果有,请提交对照序列或探针,格式请参照 SectionA.32、每条序列设计探针数目 每个探针是否需要重复: 是 否 如果需要重复,重复几次 (表达谱探针设计要求每条序列设计 3 条及以上探针,可以根据芯片探针容量以及序列数量来确定)3、定制芯片格式: 2.1M 385K 12x135K 4x72K 3x720K 4、定制芯片数目 客户单位:客户姓名:客户联系电话:客户电子邮箱:*若有任何问题,可联系博奥生物有限公司微阵列服务部 任永红 电话:010-80726868-6336;010-80729390电子邮箱:

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