文献管理与文献信息分析.pdf

1、 作者简介 罗昭锋， 自 2004 年起开始 在校 内推广文献管理软件 Endnote ， 之后每学期均举办多次培训讲 座，参加培训的学员累计已超 过 2000 人次 。2006 年编 写了 Endnote X 中文用户手册 （试 用版） ， 在网 上广泛传播。 2007 年 9 月以来，在读者的支持鼓 励下，以及五位热心朋友的直 接参与下，编写了本书。 作者供职于中国科学技术 大学生命科学实验中心，主管 蛋白质功能及药物研究平台。 主要的仪器有 BIACORE3000 、 等温滴定微量热仪 （ITC ） 、 液 相色谱系统（分析和制备型） 、 圆二色谱仪、毛细管电泳、多 肽 N 端测序仪、

2、高通量药物筛 选系统、生物发光光度计、动 态光散射、紫外光谱、荧光光 谱及红外光谱。作者的主要工 作是为国内生命科学及相关科 学研究提供技术支持和服务， 欢迎校内外各单位前来交流、 测试和合作。有关详细信息， 请参考网站资料 http:/ 。 本手册的下载地址： http:/ upimg/endnote/infomanual .pdf 封面设计：朱巧云 zhuqiao_ 内 容 概 览 Endnote 海量文献信息的管理 全文管理 笔记管理 自动编排论文或书籍的参考文献 利用杂志全文模版撰写论文 统计与分析 RefViz 海量文献信息分析 文献自动分类 给出文献间相互联系 发现研究前沿和热点

3、1 小时把握 10000 篇文献 的主旨 Quosa PDF 全文信 息分析软件 自动下载 PDF 全文 自动追踪最新文献 绪 言 决定编写此书是缘于几年来的 Endnote 推广工作 以及去年编写的一本小册子。 去年国庆 期间编写了 Endnote X 中文使用手册 （试用版） ，10 月 8 日 发布在校园网上， 当初希望通 过校内读者的反馈进行修订之后再向外发布， 后来由于种种原因， 未能及时进行修改， 而这 本小册子也被转到了国内多个论坛上，逐渐开始在网上传播开来。 在过去的这一年中， 收到大量的信件， 有提出建议的、 有请教问题的， 还有很多就是 为 了表示致谢和鼓励的。 记得有位老

4、师说， 他们单位给每位老师印发了一本。 这些信件给了我 莫大的鼓励和安慰， 非常感谢各位网友的支持。 没有你们的支持、 鼓励和期待， 我很难下 舍 下手头的实验来编写此书。 信息是一个人得以生存的基础。创新实际上是我们种到头脑中的种子开花之后结出的 果实。没有输入信息的头脑，好比没有洒下种子的土地。不管土地有多肥沃，也结不出 丰 硕的果实 。 我曾考虑过一个问题，为什么现在的孩子比多年前的孩子要聪明；同时代而言， 城市里同龄的孩子要比农村里的孩子聪明。 我觉得关键就是他们接触的信息量不同。 俗话说， 种瓜得瓜，种豆得豆。要想我们的大脑结出丰硕的果实，就要种下大量而且饱满的种子 。 对科研工作者

5、而言，这些种子就是文献信息。我们播种的信息决定了结出果实的质量。任 何人的创新都是在前人的基础之上。 科学工作者如果不能掌握前人已有的工作基础， 所谓的 “创造” 不过是闭门造 车而已。 中 国有过太多这样鲜活的实例。 全面掌握前人的工作， 就如 同站到了巨人的肩膀上。 对于一个科研工作者来说， 关于文献信息我觉得要掌握三方面的能力： 一是文献信 息 的 获取能力 ； 二是文献 信 息管理能 力 ；三是文 献 信息分析 和 利用的能 力 。 文献信息 的 获取能力 相 对来说比较容易， 大致说来有以下一些途径： （1 ） 综合性数据库 （Web of Science ， Pubmed 等） ，

6、 （2 ） 专题数据库 （Gene Bank ， 蛋白质结构数据库， 分子 相互作用数据库， 化学 反应数据库等） ， （3 ） 专 利数据库， （4 ） 会议论文 数据库， （5）学 位 论文数据库， （6 ）综合搜 索引擎， （7 ）咨询和交流， （8 ）公 司的网站及产品技术手册。 文献信息 管 理能力 在网 络时代才变得复杂。 多年 前， 我们只能 获得很少量的信息， 一 般 通过记录本或者记录卡就可以进行管理。 如今每个人都可以获得大量的信息， 管理就显得重 要起来。 本书中推荐大家利用 Endnote 进行文献 管理。 它可以帮助你进行全文管理和笔记管 理等， 便于大家进行检索和分

7、析。 提供一些杂志的全文模板， 同时可以自动帮你编排参考文 献信息。 文献信息 分 析 是在文献多到无法阅读的时候才显得重要的。 如今随便用一个关键词就可 以找到成千上万篇文献， 我们不可能把这些文献一一阅读一遍， 因此就要求我们能够从这些 文献中找出最相关的信息来。 过去我们习惯不断限制检索条件， 将文献数限制在有能力阅读 的范围内。 如今通过本书， 我们为你提供了一套更好的解决方案， 那就是利用文献信息分析 软件，它们能够帮你在短时间内把握大量文献的主旨信息。本书介绍的 RefViz 和 Quosa 就 属于这类软件。 作者真诚希望本书能帮你提高驾驭文献信息的能力， 让你真正站到巨人的肩膀

8、上。 为自 己的大脑种下优质的种子。 如果你想在 Nature 或者 Science 上发表 论文， 首先就得学习 Nature 或者 Science 上别人 所做的工作。 如果我们每天只阅读那些下三滥的论文， 决不会想出奇妙的点子， 做出惊人的 创新来的。 要创造就要给大脑输入有用的信息。面对浩瀚的信息，如何快速找到最相关的信息， 如何发现这些信息之间的相互关联，正是本书想为你解决的问题。 本书介绍的三大软件，Endnote 将教你如何管理数以万计的文献， 如何管理全文， 如何 管理阅读笔记，以及如何利用 Endnote 来撰写论 文，编排参考文献等。 RefViz 是一个文本信 息 分析软

9、件 ， 可以根据 文 献标题和 摘 要信息进 行 文献分类 ，并 指 出文献间相互关系。 熟练掌握这个软件， 你将会轻松驾驭海量的文献信息， 快速获取最重要 的信息，为你提供不竭的创新思路。 Quosa 是一 款全文分析软件， 可以自动下载全文， 并对全文进行分析， 还可以提取已下 载的 pdf 中的 引文信息。 综合利用以上三个软件，基本可以满足你对文献分析与管理的需求。 这本书不同于去年编写的手册。 首先从内容上要丰富很多， 去年的手册仅包括本书中第 一部分的内容。此书中增加了 Endnote 高级功能 部分和常见问题解答。Refviz 和 Quosa 两 个软件也是新增的内容。 从编写的

10、目的来看也是大不相同， 去年只是满足于让大家学会使用 Endnote ，此 书更希望为科研工作者的文献管理与分析工作提供一套解决方案。另外， 此 书 还是集体智慧和经验的总结，避免了个人思路的局限，使其更具参考价值。 参与编写的共有六人， 分别是： 文献管理版的版主， 远在美国求学的王研， 参考我去 年 的手册， 编写了本书的第一部分； 南京农业大学博士研究生韩敏义编写了 Endnote 高级功能 部分的第四至第七章， 其中很多是我所不熟悉的， 使我获益良多； 夏春智 （山东大学博士 研 究生） 、田二 坡（汕头大 学医学院研 究生）和陈 飞（重庆大 学）三位编 写了常见问 题解答部 分，他们

11、分别搜集了我们的论坛、Endnote 网 站 、以及 QQ 群众常见的问题，并一一给出了 解决方案， 具有重要的参考价值。 一般新手碰到的常见问题都给予了很好的解决方案。 我参 与编写了高级功能部分中的主题列表和 Endnote Web 部分， 以及 RefViz 和 Quosa 两 个软件 的介绍。RefViz 和 Quosa 这两个软件目前国内应用的较少，很难找到有价值的参考资料。 因此只好翻阅原版说明书，为此打印了 RefViz 说明书的全部内容，阅读过不止一遍，仍有 很多地方不是很清楚。 这个软件其实并不难学， 难在灵活应用上， 难在通过软件获得自己想 要的信息。 这部分内容书中只能通

12、过举例来加以说明， 读者只有通过不断练习和揣摩才能熟 练掌握。Quosa 是最近才 开始学习的软件， 尽管很不熟悉， 但很多功能很重要也很实用， 一 并予以介绍，希望对大家入门起到一点指导作用。 去写这些不太熟悉的内容是需要勇气的， 总担心有误人子弟之嫌。 好在此书读者都是高 级知识分子， 能够识别出一些显而易见的错误， 才让我免了一份顾虑。 在此真诚地恳请各位 读者如果发现书中有什么错误请一一指出， 我们会将发现的错误更正信息发布在论坛上， 并 且如果有机会在进行改进的话一一予以更正。反馈的方式可以给我发送 email （smilesunustc.edu ） ，或 者将相关内容发布在论坛上（

13、http:/ 文献 管理版） 。 如 果你在文献管理和信息分析方面有好的经验， 也希望你能发布到我们的论坛上， 让更多人分享你的经验。 关于本书的版权， 如同我去年编写的手册， 只要不用于商业目的， 欢迎任何形式的传播 和转载，希望尽量保持原始文件的真实性。 在本书编写过程中， 我们参考了一些网络资源， 如在编写常见问题解答部分， 参考了 中 科院植物 研究 所综合办 公室 周凌娟编 写的 Endnote 使用 FAQ 。 在我最初学习 RefViz 时， 丁香园中一位网友写的文献分析软件 RefViz 点点通给我了一些帮助。还有些未能一一 指出的，在此一并向原作者致敬。 非常感谢各位网友给予

14、我的鼓励， 你们让我认识到这项工作的价值， 让我愿意继续为此 而努力。感 谢参与编写 本书的各位 “战友” ，尽 管我们彼此 素不相识， 但几位战友 都是经验 丰富的热心人士， 在 QQ 群以及论坛上， 为各位新手排忧解难。 他们无私的奉献， 为我们搭 建了一个交流的平台。感谢你们无私的付出，没有你们的付出，就不会有本书的面世。 我还要特别感谢我的妻子， 她对我的倾力支持， 以及她对我生活的悉心照顾， 才使我能 忙里偷闲来撰写这些文字。 罗昭锋 于中国科学技术大学 2007-11-25 导 读 本书不是研究文献管理与信息分析的理论著作， 而是通过介绍三个软件， 希望能为科研 工作者的信息管理与

15、信息分析工作提供一套解决方案。 本书介绍的三个软件分别是 Endnote ，Refviz 和 Quosa 。Endnote 是目前最 受欢迎的文 献管理软件。Refviz 是 Thomson 公司和 Ominiviz 公司合作开发的针对文献信息挖掘的一款 软件， 可以对大量的文献信息进行分析和归类， 并以可视化的图形界面将分析结果直观地显 示出来， 能帮助我们快速掌握一系列文献的主题内容， 并且可以发现文献间的相互联系。 是 处理海量文献信息的得力工具； 另外， 还可以与 Endnote 实 现无缝对接， 对 Endnote 数据库 的文献进行分析或将分析结果输出到 Endnote 。Quos

16、a 是一 款全文文献分析软件，可以自动 从网上下载 PDF 全文， 并对全文进行分析，找出文献间的相互联系。也可以对文件夹中已 有的 PDF 文 件进行全文分析，还可以自动提取 PDF 文件中的 文献信息。Quosa 还能追 踪最 新的进展， 发现新的文献能主动提醒。 该软件缺点是目前支持的数据库资源较少， 对生命科 学数据库支持较多。 本书分别以这三种软件的最新版本为例进行介绍， 但由于软件以及所介绍的数据库随时 都可能更新， 你看到的界面可能会与书中的图有所不同。 相信这些不会影响你学习和使用这 些软件。 书中的内容并没有按照软件原版的说明书那样面面俱到的介绍， 而是根据个人使用经验 进行

17、提炼和总结， 我们力求以最简单的方式表达出最重要的内容。 由于个人的使用经验往往 比较局限，这次编写这本书我们组织了六人的小组，希望能尽可能多地满足读者的需求。 本书分为三部分，分别介绍 Endnote 、RefViz 和 Quosa 。其 中 Endnote 部分最为详细， 分为基本功能和高级功能两部分。 建议初学者认真学习基本功能部分， 并熟练掌握。 高级功 能部分建议选择性学习， 或者需要用到某一部分功能时再详细学习。 但对高级功能部分的内 容有个大致的了解还是有必要的。 Endnote 部分还 编写了疑难解答， 如果碰到问题可以查阅， 如果该部分没有提供你想要的答案，可以到相关的网站/

18、 论坛或 QQ 群以咨询。 RefViz 的主要功能是用 来处理大量 的文献信息 ，以及发现 文献间相互 关系。第十 一章 是软件的基本功能介绍； 第十二章介绍了界面及菜单， 帮助大家熟悉软件的操作； 第十三章 翻译了原说明书中提供的部分应用实例。 依据作者的经验， 即使你熟悉了这几章的内容， 并 不代表你已经熟练掌握了这个软件。 这个软件的操作并不难， 关键在于你要能够理解 Galaxy 视图、Matrix 视图、Topic 以及 Serach Tool 等相互 间的关系。 只有理解了各部分之间的内在 联系，才能从软件中得到你想要的信息。所以学习这个软件，需要读者仔细揣摩。 在 Web of

19、 Science 网站， 以及 Scoups 网站上都提供了一定的分析功能，但均不能对文 献内容进行分析，因此，RefViz 有自己的特色和优势。 Quosa 是一 款全文分析软件，可以下载的 PDF 文件进行分析，也可以对已经下载到本 地的 PDF 文件夹中所有的 PDF 文件进行分析。 Quosa 提供 的 PDF 全文自 动下载功能可以为 我们节约不少的时间。 另外， 该软件还可以根据用户的设定， 自动追踪最新的相关文献， 节 约了我们每天去浏览网站的时间。该软件还能够识别 PDF 文件中的文献信息，对于我们利 用 Endnote 管 理全文方便了很多。 由于作者对这个软件也是刚刚开始学

20、习， 很多内容不甚了解， 介绍的内容也比较少。 建 议读者通读这一章，在此基础上进一步学习软件的其它功能。 三个软件是相互补充的， 功能各有侧重， 建议科研工作者学习并掌握这几款软件。 文献 信息分析对我们的科研生涯是至关重要的。 把握全面、 前沿的信息， 尤于站到了巨人的肩膀 上。 相反， 不能快速了解和把握前沿的信息， 我们的很多工作可能都是在低水平重复。 获取 信息速度和获取信息的质量决定了一个人起步的高度。快速获取信息，让我们在激烈的竞 争中领先一步。 当写完书中的内容时， 总觉得还有很多非常重要的内容没有写到。 譬如如何综合运用这 些工具， 以及如何解决研究生和教授所面临的信息问题等

21、。 书中也缺乏很有代表性的综合分 析实例， 这些不是我个人能很好解决的。 信息的可视化分析本身也是一门新兴学科， 用到具 体科研中还需要一段时间的摸索。 文献信息分析是需要一定的积累才能灵活把握的。 我们会 不断积累经验， 提高自身素质， 并将自己的经验与大家一起共享。 书中所发现的错误以及将 来更新的内容我们会发布在论坛上， 欢迎大家常光顾我们的论坛 （http:/ ） ， 并希望您能为论坛这样一个共同的交流平台的发展贡献一份力量。 放下自己的实验和其它工作， 来撰写这样一本书， 希望能为提高科研工作者的信息处理 效率尽一份力，为中国的科技进步尽一份力。 目 录 Endnote 基本知识 第

22、一章 EndNote 软件简介. 1 一、EndNote的基本功能 . 1 二、EndNote X1 的新功能 2 第二章 数据库的建立. 3 一、EndNote程序主界面简介 3 二、数据库的创建 . 4 数据库建立的第一种方式：手动输入建立数据库 5 数据库建立的第二种方式：用软件直接联网下载 7 数据库建立的第三种方式：网上数据库输出 10 数据库建立的第四种方式：格式转换. 15 三、附件的管理 . 18 第三章 数据库的应用. 19 一、如何利用数据库来撰写论文 . 19 二、利用论文模板撰写论文. 21 Endnote 高级功能 第四章 Filter(滤镜)的操作 26 第五章 S

23、tyle操作 . 35 第一种方法 下载最新的style 35 第二种方法 利用相近的style进行修改 . 36 项目 1-Anonymous Works. 38 项目 2-Page Numbers：在此项目中改变页码的显示方式。 . 40 项目 3-Journal Names. 40 项目 4Citations 42 项目-Bibliography 46 项目-Figures & Tables 50 第六章 更改EndNote的偏好设定（Preference） 52 一、添加Endnote启动时打开的文献库. 52 二、界面的美化显示字体(Display Fonts) 53 三、文献类型的

24、修改(Reference Type) 55 四、Temporary Citations(临时引文)的表示 61 五、Sorting(文献排序)设定 61 六、Change Case（更改大小写） . 62 七、Display Field（显示字段） 62 八、重复文献（Duplicates）标准的确定. 63 九、Online（联网） 64 十、Folder Locations（文件夹位置） . 64 十一、Term List（术语列表） 65 1十二、Spell Check（拼写检查） 65 十三、URL & Links（网址和链接） 66 十四、Word 2007 中CWYW偏好设置 67

25、 第七章 Term List(术语列表). 70 一、术语列表的作用. 70 二、创建术语列表. 72 三、.删除与重命名术语列表. 74 四、在术语列表中手动输入新的术语. 74 五、批量输入术语. 75 六、导入导出术语列表 . 76 第八章 主题列表（subject bibliography） 79 一、不同年代发表文章的统计 79 二、不同作者发表文章的统计 83 三、关键词分析 84 第九章 EndNote web功能简介 . 85 一、EndNote Web与单机版EndNote的比较 85 二、EndNote web注册. 86 三、EndNote web的使用. 87 四、利用

26、Endnote web编辑论文的参考文献 92 第十章 EndnoteX1常见问题及解决方案 . 94 RefViz基本知识 第十一章 RefViz简介 . 105 一、软件基本功能示例 . 105 二、RefViz工作原理 . 106 三、软件架构 108 四、安装运行 109 五、主界面简介 109 六、Endnote中数据库的分析 109 七、利用RefViz分析发展趋势 111 第十二章 界面及菜单. 113 一、主界面 113 二、快捷菜单及鼠标快捷键 116 三、File菜单 119 四、Edit菜单. 122 五、Visualizations菜单 126 六、Tools菜单. 1

27、27 七、Help菜单 . 128 第十三章 文献信息分析 . 129 一、三种来源文献的分析及视图创建过程 . 129 二、Galaxy视图. 133 三、Matrix视图. 136 四、主词工具（topic tool） . 139 2 3 五、搜索工具（search tool） 141 六、同义词 144 七、输出文献到文献管理软件 146 八、文献信息分析. 147 Quosa 基本知识 第十四章 Quosa软件简介. 151 一、软件的安装及主界面简介 151 二、文献检索及全文下载 . 152 三、检索Google Scholar . 154 四、文献追踪 155 五、Pdf文献信息

28、识别. 156 六、文献信息分析. 158 七、输出文献到文献管理软件 160 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/1 第一章 EndNote 软件简介 EndNote是 THOMSON 公司推出的最受欢迎的一款产品，是文献管理软件中的佼佼者。 不管是和其它公司的产品相比， 还是与 THOMSON 公司的另外两款软件 Reference Manager、 Procite 相比，EndNote 显然受更多人的喜爱。 常见文献管理软件有 THOMSON公司的 EndNote， Reference Manage

29、r， Procite，以及基 于网络的 refworks。其 中 EndNote是最受欢迎最好用的软件， Reference Manager提供网络功 能可同时读写数据库，Procite 提供弹性的群组参考及可建立主题书目。中文文献管理软件 中 NoteExpress是目前较好的中文文献管理软件。 一、EndNote的基本功能 EndNote 通过将不同来源的文献信息资料下载到本地，建立本地数据库，可以方便地 实现对文献信息的管理和使用。工作原理如下图所示： 通过将不同来源的数据整合到一起，自动剔除重复的信息，从而避免重复阅读来自不同 数据库的相同信息。同时可以非常方便地进行数据库检索，进行一

30、定的统计分析等。另一个 重要的功能是，在撰写论文、报告或书籍时，EndNote 可以非常方便地编排参考文献格式。 还可以非常方便地做笔记，以及进行某一篇文献相关资料的管理，如全文、网页、图片和表 格等。 整个软件的架构主要包括数据库的建立，数据库的管理和数据库的应用三个方面。 功能模块 程序模块 基本功能 其它 数据库建 立 数据库建立的四种方式及注意事项， 检索 （通配符， 起止年代，检索策略的储存与调用） ，拷贝，复制， 删除，添加，全文管理，网址，图片等，转换， ， 连接的更新，及设定 文献管理 数据库管 理 重复，排序，统计，分析，查找，栏位显示查找重 复，export 撰稿引文 编排

31、 数据库的 使用 如何引用文献，引用的几种方式，输出格式，论文 模板，自行设定 常见问 题的处 理，及其 它注意 事项 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/2 学习并掌握文献管理软件，可以提高我们阅读文献，获取信息的效率，可以省去撰稿文 稿时手动编排文献的麻烦。同时 EndNote 可以非常方便地作笔记，并对笔记进行管理。为 我们撰写综述，或阅读大量文献时提供了极大的方便。 二、EndNote X1 的新功能 (一)、在数据库文件（Library）中建立群组（group） ，便于浏览和管理文献。 每一个

32、EndNote X1 数据库中可以建立最多 50 个自定义群组（group） 。为了便于管理， 可以将不同分类的文献从 All references中拷贝、粘贴或直接拖拽到相应的群组（group）中。 而系统也会自动在检结果、文献导入、从 EndNote Web 和 ISI Web of Knowledge 导入参考 文献时自动做分类。 (二)、Microsoft Word 2007中的 Cite While You Write(TM)功能 Word 2007 Windows版本里在会出现一个 EndNote X1 的菜单。这个菜单取代旧版的工 具栏，让使用频繁的 Cite While You

33、 Write 功能容找到而且只要点一下就可以使用。 (三)、在数据库文件中更详细的浏览和管理 在 Library列表视窗中即可呈现所有作者，从而可以更详细的浏览。Link to PDF一栏更 改 File Attachment，每个参考文献可以储存 45 个文件。自定义的文献类型也可以更轻松地 在不同电脑间导出和导入。搜索窗口的字体以及文献栏标签也可以自行设定。 (四)、其它新功能 工具栏新增的快速搜索功能可查找所有栏目（field） 在 File Attachment 一栏可看到文件名称 确认新的参考文献预设偏好的改变 工具栏中的 Connect 改名为 Online Search 输出格式

34、 Show All 改名为 Show all fields Image一栏改名为 Figure，对应于 Cite While You Write 中的 Insert Figure 功能 主题书目(Subject bibliographies)包含参考文献类别一栏 自动转换 Procite 数据库至 EndNote数据库 工具栏中的 Transfer references更名为 EndNote Web Electronic Resource Number栏更名为 DOI 栏 与 MS Word插件如 Snag-It 和 FlashPaper更好的兼容 (五)、全新方式查询、收集参考文献 您可以很

35、快使用 EndNote Web 与同事合作。一篇文章中可以同时引用 EndNote 和 EndNote Web的文献并转换 libraries。EndNote X1包括全新以及更新后的数据库查询资源、 导入文献和书目格式设定。您可以找到 1500 多个数据库连接设定文件、600 多个导入格式 以及 2800 多种期刊格式。 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/3 第二章 数据库的建立 本章内容导航 数据库建立是文献管理及应用的基础，所以本章首先介绍如何建立数据库。建立数据库 就是将不同来源的相关资料放到一

36、个文件中，汇聚成一个数据库文件，同时剔除来源不同的 重复文献信息，便于分析、管理和应用。 本章首先对程序主窗口进行了简单介绍，然后，介绍了几种建立数据库的不同方法。 一、EndNote程序主界面简介 在介绍数据库的建立之前，简单介绍一下程序的主窗口。运行 EndNote 后，出现的第 一个界面如下： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 在以上窗口中选择要打开的数据库文件，也可以新建一个数据库文件。点击 cancel 不 打开任何文件。在上图中点击 OK，就会打开 CuZn 的数据库文件，进入后界面如下： 群组 文献信息， 每一行 代表一条文献 以选择的输出格式预览选定

37、的文献 在上面窗口中，用鼠标双击某一条记录就可以显示该记录的详细信息，并且可以进行编辑。 EndNote中一般的设定会被及时保存，设定完毕或输入完毕，关闭即可。 二、数据库的创建 下面我们以新建一个名为 SPR 的文献数据库文件为例，来介绍如何建立本地数据库。 新建数据库的方法可以在启动程序时选择 Create a new EndNote Library，也可以在程序的主 界面，选择 filenew，选择文件保存地址并输入文件名。 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/ 4 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心

38、网络发行，下载地址 http:/5 新建的空数据库文件如下： 数据库建立的第一种方式：手动输入建立数据库 EndNote软件中建立数据库的方式有四种：手动输入，直接联网检索，网站输出，格式 转换。 手动输入主要针对少数几篇文献，无法直接从网上下载，或者一时的想法等。手动由于 工作量较大，无法应付大量的文献工作。 在上图中点击快捷键 New Reference，也可以在 references菜单下选择 new reference。 New references 的界面如下图。 输入文献的信息窗口如下图所示，每条文献记录有多个字段组成，包括 Author、Year、 Title 等。下拉菜单显示的

39、是文献的类型，选择文献类型是期刊论文（Journal Article） 、或是 书（Book） 、或是专利（patent） ，所显示的字段会有所差别。EndNote X1 中提供 39 中文献 类型。 手动输入文献信息方式比较简单，首先选择适当的文献类型，按照已经设好的字段填入 相应的信息即可。并不是所有的字段都需要填写，可以只填写必要的信息，也可以填写的详 细些。注意：人名的位置必须一个人名填一行，否则软件无法区分是一个人还是多个人名， 因为各个国家人名的表示差异较大。关键词的位置也一样，一个关键词一行。 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学

40、实验中心网络发行，下载地址 http:/6 如下图所示，输入完毕，点击右上角的关闭即可。 作者姓名按图中格式输入，如果作者已经存在于当前数据库中，输入的人名会显示为黑色， 如果作者名第一次输入则显示为红色。一条记录输入完毕，点击右上角关闭即可。该记录在 主窗口显示如下： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/7关于 PDF 文件，网址以及图片等等的管理，如何链接到一条记录将在本章末尾讲述。 数据库建立的第二种方式：用软件直接联网下载 第一步：设置常用数据库 设置常用数据库，如下图所示： 打开数据库链接（op

41、en connection manager） ，出现下面的界面，选择常用的数据库，点 击关闭。 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/8 第二步：联机检索及检索策略 ，toolsconnect下面，选择 PubMed 就可连接到 PubMed 网站进行检索相应的文献了。 上面选定的数据库链接就会出现在上图中点击 PubMed，如果你的计算机能够链接到 PubMed 网站的话，就会出现如下的 检索框： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载

42、地址 http:/9此时你可以象链接到网站一样方便地进行检索了。检索时注意检索词之间的逻辑关系。 如果是跨时间段检索，注意在两个时间之间用英文冒号隔开。在 PubMed中支持具体日 期格式，可以检索某两天之间的文献，如 2006/01/01:2006/06/30；在 web of science 中只支 持年代， 只能检索两个年代之间的资料， 如 2003:2004,表示检索 2003 和 2004 年的相关文献。 有些网站可能不识别冒号，可以用短横线“-”连接，如 2003-2004。 在检索窗口的左下方有一些命令，可以通过这些命令来增减检索栏位的多少，如果需要 用同样的检索条件检索不同的数

43、据库，可以将检索策略储存，在检索其它数据库时简单调用 即可。当检索条件特别复杂的时候，这样可以节省每次输入检索条件的时间，还避免了可能 误输入产生的错误。需要注意一点的是：不同数据库提供的检索字段有很大差别，如上图 PubMed 提供了 24 种检索栏位，还可以搜索所有栏位；而在 web of science中，只提供了 6 种检索栏位，如下图所示，如果直接调用 PubMed 中的检索策略到 WOS 中检索，会产生一 些错误，因此，需要做一些调整。 输入待检 索的内容 输入待检 索的内容 检索策略的储存与调用 增加或删减检索栏位 选择相应的 逻辑关系 当前的远程数据库文献管理与文献信息分析 罗

44、昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/10 在上面 PubMed检索框中，点击 search，将会返回检索结果： 表明共检索到 614 条符合条件的记录，点击 OK 即可全部下载。在上面两个方框中也可 以对数字进行修改，如将 614 改为 10，将只下载前 10 条文献记录。检索到的文献按时间顺 序依次排列，排在前面的表示较新的文献，排在后面的时间久远一些。 点击 OK，出现下载界面： 待下载完成可以新建一个数据库，或者拷贝到已经存在的数据库中。注意，上面下载的 界面中，文献只是暂存，如果直接关闭这些信息将丢失，如果需要全部或部分信

45、息，应将需 要的部分信息加以保存。 关于检索栏位的增删，检索策略的储存与调用请自行摸索一下。 数据库建立的第三种方式：网上数据库输出 目前有很多网上的数据库都提供直接输出文献到文献管理软件的功能。如 Scopus， web 已下 载文献将下载的文献拷贝到目标数据库 下载进程，共 614 篇，已下载 201篇 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/11 of science 等。 Web of science 可以直接输出到 EndNote， 而 Scopus则需要通过格式转换才能 正确地导入到 EndNot

46、e中。下面以这两个数据库为例加以说明。 从 web of science 输出文献资料 链接到 WOS 数据库，输入检索词 SELEX，共检索到 490 条参考文献： 在右边选择要输出的记录范围，然后点击 EXPORT TO REFERENCE SOFTWARE，将 会进入如下界面： 当文件传送到本地之后，会跳出一个选择目标数据库的窗口： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/12 选择你要将这些资料保存到哪个数据库，选定之后，点击打开即可将 WOS 网站上的资 料输送到目标数据库中。 从 Scopus 输

47、出文献资料 连接到 Scopus 数据库，检索 SELEX： 检索结果如下： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/13共得到 585条记录，这里选择 page，即选定当前页，共 20 条记录，点击 output。 注意从 Scopus 输出文献时， 由于 EndNote中没有与 references对应的栏位， 所以输出时不要文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/14 选择 references，否则导入时会出现错误。

48、Export for 那里要选择 RIS格式，点击 Export，选 择输出位置和文件名，例如 scopus.ris。打开 EndNote 软件，选择 fileimport： 转换进行中： 导入完毕，20 条记录全部显示在数据库中，如下图所示： 文献管理与文献信息分析 罗昭锋 韩敏义等编著 版本 1.00 中国科学技术大学生命科学实验中心网络发行，下载地址 http:/15 数据库建立的第四种方式：格式转换 通过格式转换相对来说是种比较麻烦的方式，不是迫不得已，一般不会采用的。格式转 换一般把资料保存为文本文件，然后导入到 EndNote 中。要选择正确的 filter，否则无法正 确转换。 对于中文的文献资料信息，可以先保存为文本，按照 EndNote 程序的要求进行一定的 替换，然后再导入即可。具体方式请参见英文说明书。也可以利用 ultraedit来