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6-分子动力学.pdf

上传人:精品资料 文档编号:10897107 上传时间:2020-01-19 格式:PDF 页数:11 大小:209.94KB
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资源描述

1、第五章 分子动力学 第一节 Verlet 算法 牛顿方程 iiimfdtrdvv=22记 ( )NrrrRvLvvv,21= =NNmfmfmfGvLvv,2211方程写为 2dRGdt=vv三点公式 ( )()242111122nnnnnnnRRR GRRv +=+ +=+vvvvvvr如果给出初始条件0Rv和1Rv,可求解方程,但常常给出的初始条件是00, vRvv, 那么 020012GvRR +=vvv(为什么? 因为dvGdt=r,所以, , 000() ()tvt v dt Gt v tG=+ +rrvnull00所以,210 0 0 0 00( )R RdtvtGR v G=+

2、+ + +rr rrrnull) 方法的优点: 保持时间反演不变性,即令 nn, 方程形式不变 (尽管误差会破坏这一对称性) 如果问题与 vv无关,计算精度相当高 方法的缺点: 必须用到nvv1nR+v(为什么是缺点?) 另一方案 ()()2221112!()2nn nnnnnnRRv Gvv GG +=+ + +=+ + +vvv缺点:失去时间反演不变性 第二节 多体问题的基本方法 (阅读材料) 全同粒子,概率分布为 ( ) ( )NrrrWRWvLvvv21,= 物理量平均值 () ()()1iiA A R W R dR dR drZZWRdR=vvv vvvv分子动力学 ()=01lim

3、 dttAA个粒子处于n( )nrrvLv,1的分布密度函数 ()()()+=NnnnrdrdRWnNNZrrrvLvvvLvv121!1,()!nNN来自 个粒子中取 个的组合数 N n例如: 是 1 Nn =是 1=n N通常记 () ()rrvv1 = ,称系统的粒子密度 定义 () ( )1Niirr=vvrv则 () ()rr=vv证明:这是显然的 () ()( )()111221 ,NiNiNNiirrrWrrZNWr r r drZ= idrvvvvvLvv v vLv)这里假设了(NrrWvLv,1是关于交换irv和jrv对称的 还可证明 ( ) ( ) ( ) ( ) ( )

4、2,rr r r r r r=vv v v v v v证明: ()() ()()()111NNijijrr rr rrWRdZ =vvvv vv vvR如 ()()=NiiNrdrrrrWNNZrr33,!2!1 vvLvvvvv如 ( ) ( ),rr r r =vv v v多出一项, 来自 的贡献。 ()(=Niiirrrr1vvvv )我们定义粒子对分布函数 ( )rrgvv,如下 ( ) ( ) ( ) ( )2,rrr rrgrrr r +=+ +vvv vv vvv v当系统的密度比较均匀时, ( ),gr r r +v vv退化为 ()()1Nijijgr r rN=v粒子对分布

5、函数包含体系丰富的关于平移对称性的性质 z 对固体,粒子对分布函数在晶体格距呈现尖锐峰值 z 对液体,分布函数只呈现平坦峰值,而且随距离迅速消失 类似地,还可以定义关于对称性的物理量。 第三节 分子动力学的简单应用 1二维固液相变的磁偶极子模型 Hamiltonian H=K+V K 是动能项,势能项 31()i jVrrnull r r 在实际模拟中,为了节省计算时间,可以切断相互作用的力程。但无论如何,带有相互作用的系统的模拟比硬碟模型困难多了。 我们特别关注对称性 空间关联函数 6,( ) exp( 6( ( ) (0)ij ijgr i r, =r时间关联函数 6,( ) exp( 6

6、( ( ) (0)ij ijgt i t, =数值模拟结果 与实验结果较好吻合 2二维 理论的 Hamiltonian 动力学 4假设是孤立系统, Hamiltonian 为 ()+=+iiiiiimH42222!41212121其中ddt=, Hamiltonian 方程为 ()2232123!iii i idmdt+=+ i应当指出,这里我们已经把 定义在格点上。在连续极限下,这便是Ginsburg-Landau 理论。 应用 z 场论 z 宇宙学 z 统计物理学 z 凝聚态物理学 . Verlet 算法 ()() ()2222iii idtt tdt + + 在相变点附近,由于动力学慢化

7、,求 解方程到平衡态比较困难。点阵太小,存在有限点阵效应。点阵太大,关联时间长,难以达到平衡态,误差难以控制。 如果我们已经非平衡态动力学,这一困难不存在。 假设初始状态是高温态, 即随机态。我们测量宏观物理量, 如磁化等,随时间的演化,可以确定相变点以及相关的临界指数。 物理量的测量,例如,磁化强度和它的二次矩 2()1kkiiML= , k=1,2 自关联函数 21() (0) ()iiiA ttL= 磁化的标度行为 ()( )0001, 1, ,xzzzM tm t Mt tm =( ) ztFtmm100 ) (small从这式子我们可以测量相变点(即相变能量) ,指数 和 1/ z

8、从时间自关联函数和磁化的二次矩可以测量指数 z 和 / 结果可以和 Ising 模型以及 Monte Carlo 动力学比较 键是 Lorentz 不变性被破坏,所以,1 .25 2.165(10) .191(1) Ising .95(5) .24(3)2.148(20).176(7) Z421z 关 现在人们对它又感兴趣,一方面是纳米材料的兴起,产生能量的 定向流动,由能量守恒,我们得到热传导方程 3 一维热传导的简单模型 热传导已经是一个古老的物理问题。另一方面是低维热传导有些不同于高维的特点,如热传导系数发散等。 在环境温度差的驱动下,(,)df x tj(,)xtdt=r r其中 f(

9、x,t) 是能量密度分布函数, (,)j xtr是能流密度矢量。在稳态时,Fourier 定律假设 () ()j xk=rTxr热传导系数。对 维系统, k 发散。 最简单情形, 是一些半园。管子两端分别射出一些粒子,可以看到能量从高温端向低常数 k 称 一一个简单模型 一根空心管, 管内壁设置一些障碍物,出射粒子的速度由两端的温度决定。温度高的粒子速度快,温度低的速度慢。 用分子动力学方法模拟粒子的运动,温端 传递。按照温度是平均动能的概念, 21()Tx mv=2ii密度, 再测量能流221jmv=而计算热传导系数。一般地, 从kLnull 其中 L 是体 尺系的 寸, 是正数,其数值与体

10、系有关。 . A参考文献: D. Alonso, R rtuso, G. Casati, I. Guarneri, Phys. Rev. Lett. 82, 1859 (1999) 结: 动力学方法 统的基本微观运动方程 误差有时不易控制 统的平衡态或非平衡态问题 较节省时间 小z 分子求解多粒子系广泛应用 比较耗时,z Monte Carlo 方法 求解多粒子系处于微观或介观层次 较广泛应用 简单实用,比z 有限元方法 求解宏观 或介观运动方程 例如,静电势的 Poisson 方程 24(),dxx= 20,1dx把空间分割成许多小块,每块用坐标 ix标记。设 niii 1() ()nx a

11、u x= =其中 定义于 ()iuxix附近的局域函数。 然 n 显 ,如果 足够大,()nx可以逼 ()x近方程的解 。如果 nx有限,记方程的误差为 () ()nnrx x 4 ()=+ 我们的目标是选取恰当的 使 极小。例如,引入 ini其中 是一个权重函数,然后取 使 为零。这样,条件 ) (ijj ijxx便等价于一个 n 元的线性方程组 阵,而 ()iiwx现在,ia ()nrx1() ()gdxrxwx=0()iwxiaig1 ( ) 4 ( ) 0ngdxaux w=+=0Aa b a是ia的列矩14()bdx x=0)()(10xwxudxAijij=例如, Galerkin

12、 方法 设 ,取() 0iux () ()iiwx ux= , 111()/ ,( / 0iii i() ) ,iix xh xxxx x h x xotherwise+= 这里1试题: I ( 50 分) 1)设积分 dx,试证明 u x x10,0,ii nhx x x x+= = =()baSfx=()10()nkkSh fx h=+ , ()121x+01( ) ( )2nkkkS h fx f h=+ , 其中 。 2) 设 10,kk nhx x x a x b+= = =( )xfx e=,具体写出上述两个表达式。 II ( 50 分) 1)设积分 SfxWxdx=, 假设我们可以按照分布 W(x)得到()()balM x个点,则 ()1() 1/llSfxM=1MM=+, 如果用 Markov 过程产生lx,转移矩阵应当满足什么条件? 2)设 ( )xWx e=,写出相应的 Metropolis 算法的转移矩阵。

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