1、实验 1,颊粘膜上皮细胞基因组DNA的抽提及ACE基因多态性分析,一、实验目的,掌握从微量来源的组织细胞中抽提基因组DNA 掌握PCR技术原理 了解基因多态性分析的方法。,二、原理,基因组DNA抽提碱裂解法抽提基因组DNA(本实验)用蛋白酶K和苯酚提取大分子DNA裂解-蛋白酶K-沉淀法快速提取DNAACE基因多态性分析PCR方法分析基因多态性,真核生物基因组中非编码序列多于编码序列,基因组,编码序列,非编码序列,调控序列,重复序列,高重复序列(串联排列,大卫星、小卫星、微卫星),中重复序列(散在分布;部分编码;Alu家族),低重复序列或单拷贝,Alu家族 重复单位:300bp左右;130+31
2、+130bp 具Alu酶切位点 30-50万次 功能:基因调控 Alu元件的插入、删除和重组与许多先天性遗传疾病和癌症相关,ACE基因多态性分析 (血管紧张素转换酶, Angiotesin converting enzyme, ACE),基因诊断:利用现代分子生物学和分子遗传学的方法,从DNA、RNA水平检测基因的存在、结构异常和表达状态,从而对疾病做出诊断的方法。 基因多态性:指在一随机婚配的群体中,染色体同一基因座位点上有两种或两种以上的基因型,它可决定人体对疾病的易感性、临床表现多样性和对药物治疗反应的差异性。,理论基础ACE基因第16内含子存在一段长度为287bp(Alu序列)的插入/
3、缺失(I/D)多态性片段,I/D多态性与血液ACE水平有明确关系,DD型ACE水平最高,ID次之,II最低。左室肥大患者中DD型频率明显增高。实验原理以DNA为模板,ACE基因特异的引物序列位于287bp插入/缺失片段的两侧进行PCR扩增,故II型扩增片段长度约为490bp,DD型扩增片段长度约为190bp,ID型扩增片段为个,分别为190bp和490bp。根据PCR扩增片段的大小可进行多态性分析。,插入片段,插入型,缺失型,操作步骤,基因组DNA抽提 PCR反应 琼脂糖凝胶电泳检测,1. 基因组DNA抽提,溶液 10 ml 漱口20秒 收集漱口水;3000g5minRT,弃上清; 溶液 25
4、0 ul 重悬沉淀;3000g1min,弃上清; 溶液 250 ul 重悬沉淀,振荡10秒;(变性)转至0.5 ml离心管, 995min; 加溶液IV 50 ul 振荡5秒;(中和)3000g1min, 上清转移至新0.5 ml离心管,取5 ul用于PCR.,2. PCR反应,取消毒的0.5 ml离心管,加入下列成分:10PCR BufferdNTP(2.5 mM each) mix: 10lTaq DNA polymeraseDNA模板 5 l引物混合物(10M each) 2 lddH2O 3 l总体系 20 l扩增程序为:94变性30s,55复性30s,72延伸40s,共反应35个循环。,琼脂糖电泳检测,制备1琼脂糖凝 点样,电泳 紫外灯下观察结果,ACE基因多态性电泳图,2k,1k,750bp,500bp,250bp,100bp,