Pubmed数据库检索与利用.ppt

1、PubMed数据库检索与利用,江西中医药大学图书馆 查青林 2015.11.27,主要内容,2,主要内容,3,PubMed简介,PubMed是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine , NLM)下属美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)研制的基于Web的文献数据库收录全世界包括美国在内80多个国家的5000余种生物医学期刊的文摘及题录数据，内容涉及护理学、牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领域现有文献2200万余条，收录文献时间起自20世纪50年代,PubMe

2、d提供部分免费全文，包括 NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC)； 开放获取(Open Access, OA)期刊的文献； 部分出版商提供的免费期刊文献。 PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 。 MEDLINE: PubMed主体部分，记录均标有PubMed-indexed for MEDLINE In Process Citation: 又称PreMEDLINE,记录均标有PubMed-in process Publisher-Supplied Citation:记录均标有PubMed-

3、as supplied by publisher,PubMed-indexed for MEDLINE,PubMed-as supplied by publisher,PubMed-in process,NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物医学索引(Index Medicus ,IM)从1964年起，采用计算机进行电子编辑和排版，在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System)，即著名的MEDLARS系统1971年正式建立了该系统的联机系统，称为“MEDLARS联机检索系统”(MEDLARS

4、online)，即MEDLINE系统随着网络技术的发展，开发人员致力于将MEDLINE数据库的信息放到网上，供广大医务人员免费使用。从1997年6月起，PubMed开始在网上免费向读者提供服务,发展历程,收录范围广、内容齐全、回溯时间长 免费提供题录、文摘 检索功能完善、使用方便 提供检索词自动转换匹配功能、MeSH主题词检索 可直接下载全部元数据，便于利用各种工具进行分析 提供相关文献链接:Related citations, Linkout 更新速度快:数据实时更新 个性化服务(My NCBI),PubMed特点,PubMed提供检索词自动转换匹配功能(Automatic Term Map

5、ping ,ATM)。PubMed对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索，是一种智能化的检索过程。MeSH转换表Vitamin h “biotin“MeSH Terms OR “biotin“All Fields OR “vitamin h“All Fields期刊转换表new england journal of medicine “N Engl J Med“Journal OR “new england journal of medicine“All Fields作者索引 SmithJA Smith JAAuthor,主要内容,10,二、PubMed检索途径与使用方法,基本检索 高级

6、检索 主题词检索 题录检索 期刊检索,基本检索框,高级检索,题录检索,主题词检索,期刊检索,临床查询,临床试验,网址,13,输入检索式,例：类风湿关节炎（rheumatoid arthritis）应用雷公藤（triperygium wilfordii）方面的文献。,点击“Search”,显示设置,检索结果,标题含有检索词文献,标题含有检索词文献,点击“See more”,在PubMed注册自己的账户,点击篇名,点击出版物类型,相关文献,点击“LinkOut”,点击数据库名称,时间限定,文献类型限定,语种限定,限定结果,点击高级检索,检索式显示框,构建检索式,检索历史,输入检索词,显示索引,例：

7、检索2009年以来发表的有关肿瘤护理方面的英文综述性文献,输入检索词,选择检索字段,点击“Search”,完整检索式,检索结果,点击主题词检索,输入检索词,点击“Search”,例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardial infarction）方面的文献,添加到检索框检索,勾选 主题词,检索结果,输入检索词,点击“Search”,例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardial infarction）预防（prevention and control)方面的文献,确定主题词,选择副主题词,添加到检索框检索,主题词加权 检索选项,检索结果,例：通过主题词途径，检索有关心

8、肌梗塞（myocardial infarction）预防（prevention and control)方面的文献。要求主题词加权、不扩展检索,勾选加权检索、不扩展检索选项,添加到检索框检索,检索结果,题录检索,例：检索病毒杂志（archives of virology）2009年发表的基因稳定性与连续性分析（genetic stability and linkage analysis）这篇文献,输入检索信息,点击“Search”,点击期刊检索,检索框,输入刊名,点击“Search”,例：查找新英格兰医学杂志（nejm）,PubMed基本检索规则,布尔运算符AND，OR，NOT必须大写 例如：

9、vitamin OR zinc PubMed从左至右进行布尔运算，可以通过加圆括符改变运算顺序 例如：common cold AND (vitamin OR zinc),指定文献记录字段名称检索例如：DNAmh AND crickau AND 1993dp常用字段名称缩写： DP出版日期 如1998dp；输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998dp AD第一作者机构名称、地址、资助号 如tianjinad AU作者姓名 如woodsau TA期刊名称 包括期刊名全称、简称、ISSN 如scienceta或0021-9258ta LA文献出版语言 如Chinesela MH Mesh主题词

10、 如neoplasmmh PT出版类型 如reviewpt TW自由词 TI文献标题内自由词如leiomyosarcomati,作者姓名字段标识 Woodsau,输入检索词,详细检索过程,输入检索词,详细检索过程,刊名字段标识 Scienceta,输入检索词,详细检索过程,输入检索词,详细检索过程,词组检索 例如：“single cell” 截词检索：* 例如：输入infect*，可检出infection，infectious，infective，infectivity，infector等 截词检索只限于单词，对词组无效,双引号，系统进行强制检索 注意：检索词自动转换匹配功能关闭,输入检索词,

11、检索结果,详细检索过程,词组检索,输入检索词,检索结果,详细检索过程,*通配符，可同时检索含有infection，infected，infections等词的文献 注意：检索词自动转换匹配功能关闭,输入检索词,详细检索过程,主要内容,65,从图书馆网站下载NoteExpress,66,检索结果保存为Medline格式文件,67,从NoteExpress导入题录及在文章中引用,68,主要内容,69,结果存为XML文件,70,将XML文件数据转换为数据表,71,利用GoPubMed检索PubMed数据库,72,Gopubmed的统计功能,73,中医药研究文献快速增长,74,感谢您的聆听！,查青林,