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苯酚法提取RNA.ppt

上传人:精品资料 文档编号:10247783 上传时间:2019-10-24 格式:PPT 页数:23 大小:5.87MB
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资源描述

1、苯酚法提取酵母RNA,小老师:吕留帅 邹建 指导老师:肖靓,基本原理,细胞内大部分RNA 均与蛋白质结合在一起,以核蛋白的形式存在。因此,提取RNA时要把RNA与蛋白质分离并除去。将细胞置于含有十二烷基磺酸钠(SDS)的缓冲液中,加等体积水饱和酚,通过剧烈振荡,然后离心形成上层水相和下层酚相。核酸溶于水相,被苯酚变性的蛋白质或者溶于酚相,或者在两相界面处形成凝胶层。,本实验采用的0.15mol/L 缓冲液系统可使大部分RNA-蛋白复合物解离,而DNA-蛋白复合物只有极少部分解离;用酚处理时DNA-蛋白复合物变性,在低温条件下从水相中除去,这样得到的RNA 制品中混杂的DNA 极少。用氯仿-异戊

2、醇继续处理RNA 制品,可进一步除去其中少量的蛋白质。最后用乙醇使RNA 从水溶液中沉淀出来。本法得到的RNA 不仅纯度高,而且多呈自然状态,可供继续研究之用。,基本原理,主要试剂:,(1)SDS-缓冲液:0.3 SDS,0.1mol/L NaCl,0.05mol/L 乙酸钠,用乙酸调到pH5.0。,SDS,NaCl,乙酸钠,主要试剂,(2)饱和酚液:重蒸苯酚用SDS溶液饱和。,主要试剂,(3)氯仿-异戊醇液:241(V/V)。,氯仿,异戊醇液,主要试剂:,(4)含2乙酸钾的95乙醇溶液。,主要试剂:,(5)无水乙醇(6)溶菌酶(B.R.(1mg/L),主要仪器:,(1)台式高速离心机 (10

3、000r/min),主要仪器:,(2)Eppendorf 管(50mL),主要仪器:,紫外可见分光光度计,主要仪器,分析天平,主要仪器,真空干燥器,主要仪器,电子天平,实验步骤:,1粗提取RNA称量干燥的Eppendorf管的质量,取活性干酵母在研钵中研碎,取1g加入Eppendorf管,加10mL SDS-缓冲液使成匀浆。再加溶菌酶1mL,混匀,室温静置10min,再加10ml饱和酚液,室温下剧烈振荡5min,置冰浴中分层。,实验步骤:,2分离RNA在04低温环境下,10 000r/min 离心10min。吸出上层清液,转入新的Eppendorf 管。 3提纯RNA加同上清液等体积氯仿-异戊

4、醇,室温下剧烈振荡2.5min,然后10 000r/min 离心5min。吸出上层清液,转入另一新Eppendorf 管。,实验步骤:,4沉淀RNA加2 倍体积95乙醇(含2乙酸钾),在冰浴中放置30min,使RNA 沉淀。再以10 000r/min 离心5min,弃上清液,,实验步骤:,5洗涤RNA沉淀用少许无水乙醇洗一次,迅速离心各1min,保留沉淀。倾去乙醚后,减压真空干燥,准确称重,记录。,实验步骤:,6RNA 制品纯度的测定及RNA 提取率的计算 将干燥后RNA产品配制成浓度为1050gml的溶液,在紫外可见分光光度计上测定其260nm处的吸光度,按下式计算RNA制品纯度及RNA 提

5、取率,实验步骤:,RNA含量=,RNA提取率=,100%,式中,A260为260nm处的吸光度;L为比色杯光径(cm);0.024为lml溶液含lgRNA的吸光度,注意事项:,1、注意安全,试验要用到的有机试剂有毒性,特别是重蒸酚。 2、使用离心机时,对称的两只Eppendorf管的质量一定要相同,以保证重心在轴心上。,注意事项:,3、有些Eppendorf管,密封不紧,一定要注意防漏。还有的Eppendorf管底部有裂纹,在离心时要把要把有裂纹的一侧放在内侧,防止Eppendorf管炸裂。 4、由于我们用的是260nm不可见光,要用石英比色皿。 5、石英比色皿数量有限,不要和其他比色皿弄混.,祝大家实验成功,

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