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生物化学 第二章 蛋白质化学.ppt

1、第二章 蛋白质化学,第一节 氨基酸,氨基酸的通式,20种氨基酸的结构,两种C原子的标示方法(易混淆),氨基酸的构型,蛋白质中的氨基酸都是L型,不常见氨基酸,硒代半胱氨酸(有时被认为是第21种氨基酸),氨基酸的性质,氨基酸的两性性质,氨基酸的滴定曲线(甘氨酸为例),等电点(概念),氨基酸所带净电荷为零时氨基酸溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(pI)。,侧链基团带有可解离基团的氨基酸的等电点怎么计算?,pK1=2.19 pKR=4.25 pK2=9.67,必需氨基酸,人体(或其它脊椎动物)必不可少,而机体内又不能合成的,必须从食物中补充的氨基酸,称必需氨基酸。 对成人来说,这类氨基酸有8种,包括赖

2、氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸和苯丙氨酸。对婴儿来说,组氨酸和精氨酸也是必需氨基酸。,请记住上述必需氨基酸,携(缬)一(异)两(亮)本(苯)单(蛋)色书(苏)来(赖)携一两本单色书来 笨蛋来宿舍晾凉鞋,茚三酮反应,氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。,氨基酸参与的化学反应,氨基酸与茚三酮反应,但脯氨酸与茚三酮反应生成黄色,纸层析法,氨基酸与2,4一二硝基氟苯(DNFB)的反应 (sanger反应),DNFB(dinitrofiuorobenzene),DNP-A

3、A(黄色),+,+ HF,氨基酸,氨基酸与苯异硫氰酯(PITC)的反应 (Edman反应),PITC(phenylisothiocyanate),+,苯乙内酰硫脲衍生物(PTH-AA) (phenylisothiohydantion-AA),第二节 肽,肽是氨基酸通过肽键连接在一起形成的化合物。通常把分子量小于10000的称为肽,而分子量更大的称为蛋白质。,肽键(peptide bond),氨基末端,羧基末端,Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu,氨基酸残基,几种生物活性肽,1. 谷胱甘肽(glutathione, GSH),GSH是体内重要的还原剂,GSH过氧化物酶,GSH还原酶,NADP

4、H+H+,NADP+,谷胱甘肽在体内参与氧化还原过程,作为某些氧化还原酶的辅因子,或保护巯基酶,或防止过氧化物积累。,体内许多激素属寡肽或多肽,2. 多肽类激素及神经肽,由下丘脑分泌,其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢)。,当我们搬进一个新寝室时,我们会如何向我们的外校的同学对其进行描述?,当你看到这张图片时,你怎么向别人描述?,第三节 蛋白质的结构,蛋白质的分子结构包括一级结构(primary structure) 二级结构(secondary structure) 三级结构(tertiary structure) 四级结构(quaternary structure),蛋白质结构的

5、主要层次,一级结构,四级结构,二级结构,三级结构,primary structure,secondary structure,Tertiary structure,quariernary structure,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。,蛋白质一级结构,蛋白质一级结构测定,流程:,确定多肽链的数目 拆开并分离出每条肽链 水解测定肽链的氨基酸组成 测定肽链两末端氨基酸残基 肽链水解为小片段并测序 片段重叠得出整个肽链的序列 确定二硫键的位置,肽链末端分析,N-末端测定 (1)DNFB法(2)PTH法,DNP-氨基酸,C-末端测定 (1)肼解法,缺点:Asn,Gln,Cys被破坏,Arg转变为鸟氨酸。,(2)羧肽酶法羧肽酶能特异水解C末端氨基酸残基,其中羧肽酶A能释放除Pro,Arg,Lys以外所有的氨基酸残基,羧肽酶B只能水解以Arg和Lys为C末端残基的肽链。,二硫键的断裂,肽链的断裂(1) 酶裂解法,(2)化学裂解法溴化氰(CNBr)只断裂Met羧基参与形成的肽键。由于大多数蛋白质只含有很少的Met,因此CNBr断裂产生的肤段不多。,Sample,蛋白质的化学合成,

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