1、1,语言,统计、绘图与编程,2,第1章 R 简介-什么是R?,图1 R首页的图形 R是一种统计绘图语言，也指实现该语言的软件。,The R Project for Statistical Computing,3,简 史,R语言是从S统计绘图语言演变而来，可看作S的“方言”。S语言上世纪70年代诞生于贝尔实验室，由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。基于S语言开发的商业软件Splus，可以方便的编写函数、建立模型，具有良好的扩展性，在国外学术界应用很广。1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Iha
2、ka，基于S语言的源代码，编写了一能执行S语言的软件，并将该软件的源代码全部公开，这就是R软件，其命令统称为R语言。,4,R的特点,多领域的统计资源目前在R网站上约有4528个程序包，涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、空间分析、系统发育分析、生物信息学等诸多方面。 跨平台R可在多种操作系统下运行，如Windows、MacOS、多种Linux和UNIX等。 命令行驱动R即时解释，输入命令，即可获得相应的结果。,5,为什么选择R？,丰富的资源涵盖了多种行业数据分析中几乎所有的方法。 良好的扩展性十分方便得编写函数和程序包，跨平台，可以胜任复杂的数据分析、绘制精美的图形。 完备的帮助系统每个
3、函数都有统一格式的帮助，运行实例。 GNU软件免费、软件本身及程序包的源代码公开。,6,生物信息学来说：,7,8,9,R与其他统计软件比较,SAS: 速度快，有大量统计分析模块，可扩展性稍差，昂贵。 SPSS: 复杂的用户图形界面，简单易学，但编程十分困难。 Splus: 运行S语言，具有复杂的界面，与R完全兼容，昂贵。,10,R的缺点,用户需要对命令熟悉与代码打交道，需要记住常用命令。 占用内存所有的数据处理在内存中进行，不适于处理超大规模的数据。 运行速度稍慢即时编译，约相当于C语言的1/20。 相比点击鼠标进行操作，R仍能够大大提高效率。,11,图2 R软件首页 http:/www.r-
4、project.org/,12,CRAN,The Comprehensive R Archive Network 简称CRAN，由世界几十个镜像网站组成网络，提供下载安装程序和相 应软件包。各镜像更新频率一般为1-2天,13,Windows下载和安装R,14,15,FAQs,16,17,18,19,图 4 R登陆界面(Windows版) 路径： 开始所有程序R 3.0.1,菜单栏,快捷按钮,控制台,光标:等待输入,20,图 5 R Gui 的File菜单,21,图 6 R Gui 的Edit菜单,22,图 7 R Gui 的Packages菜单,23,图 8 R Gui 的Help菜单,24,
5、二 R 基本命令及操作,25,赋值和运算,z = rnorm(1000000,4,0.1) median(z) 赋值: “=”可以用“y-w 简单数学运算有: +,-,*,/, ,%*%,%(mod) %/%(整数除法)等等 常用的数学函数有:abs , sign , log , log2, log10 , logb, sqrt , exp , sin , cos , tan , acos , asin, atan,26,1.1 ls()1.2 rm()1.3 data(),27,1.4,28,1.1 R语言中获取帮助方法,29,30,31,1.2 R语言命令及输入格式,32,33,1.3 指
6、令的取消和订正,34,1.4 命令的输入与输出,输出 sink(),35,1.5 删除数据和对象,36,37,第2章 R 语言基本数据结构,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,第3章 R 语言对象,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,第5章 数组和矩阵,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,100,101,102,103,104,105,106,107,108,109,110,111,112,113,第6章 数据列表和数据单,114,115,116,117,118,119,120,121,122,123,第7章 导入与导出数据,124,125,126,127,128,129,130,131,132,133,134,135,136,第8章 组合表达式和控制语句,137,138,139,140,141,142,143,144,145,146,147,148,149,150,151,152,153,154,
