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日本血吸虫基因组工作框架图.ppt

1、日本血吸虫基因组工作框架图,上海,2006年5月16日,王升跃 国家人类基因组南方研究中心,承担单位:国家人类基因组南方研究中心 中国CDC 寄生虫病预防控制所参加单位:上海生物信息技术研究中心 上海交通大学医学院 复旦大学生命科学院中国科学院上海生命科学研究院 中国科学院北京基因组研究所中国农科院家畜寄生虫病研究所 生物芯片上海工程研究中心,科技部 “863” 计划重大专项 科学院 “知识创新工程”重要方向项目 上海市 “基础研究”重大项目联合攻关项目,世界性的寄生虫疾病,流行于76 国家和地区,主要为发展中国家 感染人数 2.5 亿,威胁人群 5-6 亿 死亡人数 1.5-2 万/年,重症

2、和伤残病人 2 千万人 WHO重点控制的寄生虫病之一,2000多年的历史 20世纪50年代初,流行与沿长江流域的12省、区、市,1亿人口受威胁,1160万人受感染7个省仍有血吸虫病流行,血吸虫病 中国最严重的寄生虫疾病之一,近年全国血吸虫病疫情出现上升趋势, 局部传播严重 新疫区增加 逐步向城市蔓延,2004年2月,国务院成立了血吸虫病防治工作领导小组, 由国务院副总理吴仪任组长。 强调要抓住源头,综合治理,依靠科技进步,加快防治药品开发,增加药品产量,提高药品质量,为人民群众提供高效、低毒、廉价的防治药物,坚决遏制血吸虫病疫情回升势头。, 胡锦涛主席重要指示:做好血吸虫病防治工作关系到人民的

3、身体健康和生命安全,关系到经济社会发展和社会稳定。 吴仪副总理要求:再经过七八年的努力,力争在全国基本控制血吸虫病。,2004年5月,全国血吸虫病防治工作会议:,所面临的问题,预防 群体化疗和有限的钉螺控制,难以有效地阻断传播和控制人群的反复感染 候选疫苗有效保护率低下(3040)诊断 粪便检查的依从性下降,大量人群的粪检费时费力 依然缺乏快速、简便、准确的检测现症感染及疗效考核的方法,治疗 单一药物:吡喹酮 潜在的药物耐受性耕牛感染的控制 80%的传播归因于耕牛 耕牛化疗的覆盖率低,国际血吸虫基因组研究计划,日本血吸虫 曼氏血吸虫转录组 EST 84,449/14,963 163,586/3

4、0,988蛋白质组 蛋白质 3200基因组 南方中心,寄生虫病所 TIGR/Sanger Inst. 覆盖率 6X 7X,测序战略全基因组随机测序法,染色体,Plasmid 2- 10 kb,BAC 100kb,基因组 DNA,测序,组装,基因组序列,文库构建,全基因组测序和拼装,序列拼装,日本血吸虫基因组工作框架图,基因组,蛋白质组,寄生虫的基本生物学特征 2. 与宿主的相关关系 3. 生物界中进化的过程,转 录 组,重要功能基因,生物信息学,线索: 诊断 疫苗 新药,日本血吸虫基因组工作框架图 序列公布,我国首次对一个人体寄生虫进行全基因组测序 正式向上海市研发公共服务平台生命科学与生物技术数据中心提交 向全世界公布共计300多万个DNA序列数据和序列拼装数据 血吸虫病及其他寄生虫病相关研究机构和科学家共享这一研究成果,谢 谢!,

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