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奶牛hsp70基因5'-侧翼区pcr-sscp分析及其与生产性能的关系.doc

1、动物遗传育种与繁殖专业优秀论文 奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析及其与生产性能的关系关键词:奶牛 基因多态性 生产性能摘要:本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 Hs

2、P70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第691 位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第

3、691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。正文内容本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP 分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和

4、蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,

5、第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。

6、推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP

7、 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2

8、荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性

9、能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspect

10、or 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP

11、70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元

12、件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和

13、 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR

14、-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件

15、、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生

16、物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变

17、位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不

18、显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HS

19、P70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可

20、能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HS

21、P70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A

22、 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的

23、目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,

24、并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产

25、性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。本研究的目的在于通过对娟姗牛和荷斯坦奶牛 HSP70 基因 5-侧翼区 PCR-SSCP分析,发现 HSP70 基因 5-侧翼区基因序列的多态性,采用生物信息学方法对基因启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行分析,并对突变产生的影响进行预测。同时结合 HSP70 基因的多态性和荷斯坦奶牛的生产性能数据,分析荷斯坦奶牛 HSP70 基因多态性与生产性能的关系。

26、 1 HSP70 基因 5-侧翼区PCR-SSCP 分析 根据 NCBI 上已登录的 HsP70 基因 5-侧翼区序列设计四对引物,扩增出 HSP70 基因 5-侧翼区。采用 SSCP 方法分析所得到序列在个体间的多态性,将得到的多态进行测序分析,并利用生物信息学方法对启动子区潜在调控元件和蛋白结合因子进行预测。结果发现:在 HSP70 基因的启动子区存在分布在两个多态序列中的 4 个突变位点,分别为第 602 位点 T 缺失,第 691位点 A 突变为 C,第 1220、1309 位点 A 突变为 G。通过 Matinspector 软件对启动子序列进行分析,发现多个 HSE(热应激调控元件

27、)和转录因子结合位点(SP1/GC 元件、TATA 盒、CAAT 盒、八聚体框)。其中第 691 位点的突变发生在HSE(热应激调控元件)内,可能对 HSP70 的表达产生影响。 2 荷斯坦奶牛HSP70 基因多态性与生产性能的关系 通过对奶牛生产性能的对比分析,发现荷斯坦奶牛 P2 和 P4 序列处不同基因型奶牛生产性能差异不显著(Pgt;0.05)。P2 处不同基因型奶牛直肠温度差异不显著,但 AB 型有比 BB型低的趋势。推测 A 基因可能是耐热基因,B 基因可能是非耐热基因。特别提醒 :正文内容由 PDF 文件转码生成,如您电脑未有相应转换码,则无法显示正文内容,请您下载相应软件,下载

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