1、98 年生農學院動物科學技術學系年報資料壹、重要業務及興革事項一、系主任改選，徐濟泰老師於 8 月 1 日兼任系主任。二、邱智賢、劉嚞睿助理教授於 8 月 1 日升等為副教授。三、8 月 1 日新聘劉逸軒博士為助理教授。四、吳兩新老師自 8 月 1 日起休假研究一學年。五、4 月 1 日舉辦味全公司企業徵才說明會暨就業座談會。六、4 月 23 日辦理 98 年度系所評鑑自我評鑑作業。七、6 月 7 日舉辦學系畢業典禮。八、9 月 4 日舉辦碩士班新生座談會。九、9 月 6 日舉辦新生親師座談會。十、9 月 12 日舉辦大學部新生座談會。十一、11 月 16、17 日辦理 98 年度系所評鑑實地
2、訪評作業。十二、12 月 26 日舉辦 98 年度系友會。十三、辦理各項入學招生及考試業務，包括：1. 97 學年度碩、博士班研究生學位考試。2. 97、98 學年度博士學位候選人資格考試。3. 98 學年度大學甄選入學招生考試。4. 98 學年度碩士班研究生申請逕修博士學位甄試。5. 98 學年度博士班入學招生考試。6. 99 學年度碩士班甄試入學招生考試。十四、博士班研究生李一泓、柯孟韡、龔明祥、黃瀞瑩、王雅青、邵敬之通過 97、98 學年度博士學位候選人資格考試。十五、辦理 97 學年度研究生論文學位考試，共有博士班 5 位、碩士班 21 位通過學位考試，茲將相關資料臚列如下：鄭登貴教授
3、指導博士班研究生楊卓真（冬季與夏季公豬射出精子之基因表現差異性及其生物功能性分析）；鄭登貴教授與丁詩同教授共同指導博士班研究生游玉祥（豬過氧化小體增生活化受體 和 之功能性研究）；吳兩新教授指導碩士班研究生林育審（飼 糧 添 加 黃 耆 、 淫羊 藿 及 補 骨 脂 對 蛋 雞 產 蛋 性 狀 與 免 疫 反 應 之 影 響 ）；吳兩新教授與邱智賢助理教授共同指導碩士班研究生施玲玲（建立雌二醇酵素免疫分析法應用於臺灣水牛生殖狀態之監測）；蘇和平教授指導碩士班研究生連莊平（利用多醣膠體及不同來源之食用油脂供開發機能性低脂蛋黃醬之研究）；徐濟泰教授指導碩士班研究生王喆宣（多年生花生、花生藤及太陽麻
4、於替代泌乳羊芻料之應用）、王瑋蕾（瘤胃纖維分解細菌 Ruminococcus albus 7 細菌素生產之調控）、黃愛嵐（利用瘤胃細菌以木質纖維素物質為原料生產生質酒精）；陳明汝教授指導博士班研究生陳希嘉（藉由變性梯度膠體電泳及寡核苷酸微陣列技術鑑定乳酸菌之研究）、碩士班研究生駱盈香（臺灣天然發酵火腿中菌種之鑑定與熟成時期菌相分布之研究）、黃聖閔（具機能性水解乳清蛋白肽之開發研究）；陳明汝教授與劉嚞睿助理教授共同指導碩士班研究生吳宗原（瘤胃真菌乙醯聚木糖酯酶 XynS20E 重組酵素之純化與特性分析）；丁詩同教授指導博士班研究生劉秉勳（豬脂締素及其受體表現調控機制與功能之探討）、碩士班研究生陳
5、郁仁（二十二碳六烯酸對叉頭轉錄因子 O 之調控）、 戴甄真（二十二碳六烯酸媒介PKA 增加血清澱粉狀蛋白 A 之機制）、劉利儒（血清澱粉狀蛋白 A 增進脂肪分解作用之訊息傳遞路徑）、曾郁雯（多元不飽和脂肪酸對豬脂肪細胞血管收縮素轉換酶 2 之調控）；丁詩同教授與姜延年副教授共同指導博士班研究生顏呈峰（育成期及產蛋期鵝隻基因表現之差異）；姜延年副教授與朱有田副教授共同指導碩士班研究生穆姵璇（Rad21 保護山羊乳腺上皮細胞免於凋亡之探討）、王健宇（泌乳素之訊息傳遞於不朽化山羊乳腺上皮細胞株中之探討）；鍾德憲副教授與邱智賢助理教授共同指導碩士班研究生曾泰祥（KiSS-1 與 GPR54 在小鼠萊吉
6、氏細胞功能之研究）、莊叡豐（應用硫代乙醯胺建立肝纖維化齧齒類動物模式與探討水飛薊預防肝纖維化之分子機制）；吳信志助理教授指導碩士班研究生劉惠毓（綠色螢光小與豬之骨髓間葉幹細胞分化為睪丸細胞之潛能研究）、吳奇恩（新生小鼠表皮邊際細胞之分離與特性研究）；林恩仲助理教授與王佩華助理教授共同指導碩士班研究生呂岳錚（運用微衛星標幟進行台灣豬隻產銷履歷追溯之驗證）；王佩華助理教授指導碩士班研究生簡執中（以遺傳標幟進行台灣黑毛豬生產模式與生長、屠體性狀及肌肉化學組成評估之探討）。貳、國際學術合作與交流活動一、大學部羅巧玲同學獲生農學院推薦，於 1 月 13 日5 月 25 日至美國伊利諾大學擔任交換學生一學
7、期。二、丁詩同教授研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，於 5 月 2531 日邀請美國賓州大學動科系系主任 Terry Etherton 教授至校參訪演講，演講題目： Biotechnology in Agriculture。三、與美國普渡大學合作，於 7 月 6 日8 月 24 日薦送大學部史家莉、王沐恩同學赴美參加為期 7 週之學生暑期研究遊學計劃。四、魏恒巍助理教授應中華民國養雞協會邀請，於 10 月 59 日赴日本參訪，考察蛋雞糞快速腐熟之相關技術設備。五、丁詩同教授 研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，於 10 月 2730 日邀請威斯康新大學 Eric Yen 助理教授至校研究演講
8、，演講題目：Triacylglycerol synthesis and energy metabolisA gut reaction。六、朱有田副教授研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，於 11 月 1012 日邀請日本綜合研究大學院大學先導科學研究科准教授本鄉一美博士於蒞系參訪座談。七、朱有田副教授研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，於 11 月 2627 日邀請英國德翰大學考古學系 Greger Larson 博士與亞伯丁大學考古學系 Keith Dobney 博士於 26 日上午蒞系演講，講題為：東亞豬種的演化、生物地理親緣與遷徙以豬種基因流向驗證南島語族遷徙路徑。八、丁詩同教授及林恩仲
9、助理教授研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，邀請美國貝勒醫學院兒童營養研究中心 Harry Mersmann 教授於 12 月 1 日至 23 日蒞臨本系，就相關研究交換心得，並於系上演講，演講題目：The pig as an atherogenic model。九、12 月 9 日邀請法國國家農業研究院 Dr. Elisabeth Baeza 蒞系座談，演講題目：影響鴨肉品質之因子。十、魏恒巍助理教授應中華民國養雞協會邀請，於 12 月 17 日19 日赴香港參訪，考察香港傳統市場活禽販賣體系與相關屠宰制度。十一、朱有田副教授研提國科會補助海外學者短期訪問計畫，於 12 月 2024 日邀請
10、日本國立歷史民俗博物館名譽教授篠原 徹、國立歷史民俗博物館研究部考古系副教授西谷 大與東京大學人類生態學教授准教授梅崎 昌裕蒞系參訪座談。參、教學近況一、本系鄭登貴教授、丁詩同教授、吳信志助理教授、林恩仲助理教授參與編著生物技術概論大學用書一冊，由華杏出版公司印行。二、陳明汝、丁詩同、朱有田、王佩華、陳靜宜老師獲得本校 98 年度傑出論文獎勵；陳明汝、朱有田老師獲本校教學優良獎、邱智賢老師獲本院教學優良獎；丁詩同教授獲國科會主持人獎助、俄亥俄州立大學生農學院傑出校友獎。三、博士班研究生洪偉盛（陳明汝教授指導）；碩士班研究生張偉華（朱有田教授指導）、洪瑛璟（劉嚞睿教授指導）榮獲 97 學年度生農
11、學院學生學術論文獎。四、博士班李冠逸同學榮獲 98 學年度台大勵學獎學金；碩士班戴廷宇同學榮獲振芳公司獎學金；大學部史家莉同學獲得李良玉畜牧獸醫學文教基金會獎學金；大學部黃禹之、陳威而、洪于涵同學榮獲本系聯合系友會獎學金；大學部張怡穎同學榮獲戈福江先生獎學金及農友社會福利獎學金；碩士班林原佑、沈盈妏、大學部史佳莉、林致均、陳威而同學榮獲台灣農學會獎學金。五、本系陳明汝教授指導碩士班研究生戴廷宇獲得中國畜牧學會 2009 年年會學術論文口頭發表組新人獎；陳明汝教授與劉嚞睿副教授共同指導碩士班研究生黃書瑢、劉嚞睿副教授指導碩士班研究生易秉蓉獲得中國畜牧學會 2009 年年會學術論文壁報組新人獎；陳
12、明汝教授指導博士班研究生陳彥伯獲得台灣乳酸菌協會壁報發表頭獎、洪偉盛獲得博士組優良論文獎、駱盈香獲得碩士組優良論文獎、謝馨慧獲得學士組優良論文獎。丁詩同教授所指導之碩士班研究生陳郁仁獲得中國畜牧學會 2009 年年會學術論文壁報組新人獎，丁詩同教授與王佩華助理教授共同指導之碩士班研究生許芯芯獲得中國畜牧學會2009 年年會學術論文壁報組新人獎，丁詩同教授與吳信志助理教授共同指導之碩士班研究生王兆中獲得中國畜牧學會 2009 年年會學術論文壁報組新人獎。六、5 月 8 日邀請畢業系友蕭振文博士、郭卿雲博士、許哲銘先生、陳佳宏先生回系與大學部同學座談，共同討論未來就業及讀書方向。七、6 月 5 日
13、舉辦留學申請經驗分享座談，邀請大學部葉怡辰、羅巧玲同學就暑假出國遊學、當交換學生及申請出國留學應注意事項、準備資料及經驗分享。八、10 月 20 日邀請行政院農委會畜牧處許桂森處長蒞系專題演講，演講題目：台灣養豬產業之現況與展望。九、10 月 23 日邀請利樂包股份有限公司林連峰經理 蒞系專題演講，演講題目：鮮汝之加工。十、10 月 26 日邀請美國榖物協會駐台代表張學義蒞系專題演講，演講題目：玉米之產銷現況。十一、11 月 5 日邀請東海大學客座教授陳存傑博士蒞系專題演講，演講題目：Development trend of poultry meat processing and market
14、ing in US。十二、新開課程動物科學技術產業概論。開課老師帶領修課學生參訪台北市立木柵動物園、伯昂公司、中央研究院突變鼠中心、訊聯生物科技公司、生物技術開發中心、慕德生技公司、賽亞基因科技公司、畜產試驗所宜蘭分所、福昌種豬場、宜陽牧場肉品專賣店、台灣動物科技研究所、四方牧場、常青乳牛場、大成雞隻屠宰場、元富畜牧場、台北縣肉品市場、嘉一香肉品公司、家畜衛生試驗所等，以建立學生對動物科學相關產業及研究單位之各項工作的了解。重要研究成果動物科學學群：1. 豬 70KD 熱緊迫蛋白(HSP70.2)基因啟動子：其基因型做為杜洛克豬隻背脂厚度分子標幟已於 97 年獲得美國發明專利(證書號碼：7,4
15、35,543)，98 年度與動物科技研究所合作持續進行與其他性狀的相關性分析，從完成中央檢定的 303 頭公豬該基因啟定子基因型與隻日增重、飼料效率及達 110kg 日齡的分析，發現第 1 及第 2 種基因型皆會顯著地使日增重、飼料效率及達 110kg 日齡產生降低效果，同時第 3 及第 5 種基因型則會顯著提高日增重、飼料效率及達 110kg 日齡，而且這些基因型與冷熱季節之間確有顯著之交互作用。2. 單一核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)基因型鑑定結果分析：針對固定DNA 片段之多條定序結果，我們採用 polyphred 分析 pipel
16、ine 可以依據定序圖譜分析出SNP 位點，並具有分析結果的可信度分數，提供研究人員對 SNP 基因型鑑定的確認性，以避免人眼判定的不準確性；針對使用 Illuminar 系統的 SNP 基因型鑑定，分為 ASPE及 GoldenGate 兩種方式， ASPE 針對少量 SNP (172 個)進行基因型鑑定，GoldenGate則是進行高通量的 SNP（48, 96, 144, 192 或 384 個）基因型鑑定，我們對於這類 SNP 基因型鑑定實驗所產生的偵測螢光讀值，利用 Illuminar 所提供之軟體系統進行螢光讀值之計算分析及基因型判定，並與實驗使用者進行結果討論，已完成共 2,20
17、8 個不同動植物個體的 109 個 SNP 位點進行分析。3. 建立 NTU High-throughput BLAST (HT-BLAST)平台：因應不同使用者產生之特殊序列比對資料庫需求， NTU HT-BLAST 平台能夠提供保密性資料儲存需求外，也能提供客制化的序列資料庫，協助使用者建置個人的序列比對資料庫入口，儲存比對結果並整合入其它生物資訊工具，方便使用者進行大量且希望能保密的未知序列之身份註解。我們針對台大校內大量序列比對任務的使用需求，加速比對進行及增進研究產出速率，而多數生物資訊網站所提供之 BLAST 服務，僅提供單一或少量之序列比對，目前運算叢集共包含兩台伺服器，單一伺服
18、器之軟硬體規格為：CPU: Intel Xeon E5420 (每顆為四核心之2.50GHz) x2 顆，RAM: 16GB，作業系統: ubuntu 8.04，使用者介面提供各選項註釋，並整合 HT-BLAST 各功能頁，以標籤方式引導使用者進入各頁面，操作介面並整合序列比對的流程，將上傳序列、選定查詢資料庫到設定參數選項等，利用三個步驟即可完成BLAST 比對及新增個人化的比對記錄，比對結果可分為單筆結果預欄以及序列比對圖示兩種，使用者亦可選擇一次下載打包所有的比對序列，比對結果將在保留固定時間後由系統上消除。測試結果中，NTU HT-BLAST 平台可比一般實驗室電腦節省約 15 倍的運
19、算時間。4. 大冠鷲(Spilornis cheela hoya)為臺灣保育類的鳥類，由於其外形屬於單態性 (monomorphism)鳥類，故在保育繁殖上因無法利用外表鑑別其性別，因而降低成功配對的機會。本試驗以增殖片段長度多態性 (amplified fragment length polymorphism, AFLP) 方式，進行大冠鷲之 DNA 指紋分析，尋求其性別特異之片段。試驗結果顯示，經 AFLP指紋分析後，可發現八個性別特異片段只存在於雌性大冠鷲，雄性大冠鷲則無此些片段。進一步將此些僅發現於雌性大冠鷲之特異片段構築於載體後進行序列分析，並設計引子組對大冠鷲樣本進行 PCR 增幅
20、，結果顯示，發現其中兩組引子 CseAFLP32 及 CseAFLP46 增幅結果具有性別特異性。CseAFLP32 引子組於雌性大冠鷲增幅出 109 bp 之片段，雄性大冠鷲則否；CseAFLP46 引子組則於雌性大冠鷲增幅出 232 bp 之片段，於雄性大冠鷲則是約 250 及 280 bp 兩片段。本研究結果成功篩選出兩組引子組可準確運用於大冠鷲之性別鑑定，以提高人工配對效率達到臺灣稀有保育類野生動物之保育繁殖。5. 猛禽位於食物鏈之頂層，可作為監測生態系統之指標。大冠鷲 (Spilornis cheela ) 在世界上可區分為 21 個亞種，臺灣區域分布屬於亞種 Spilornis c
21、heela hoya。本研究之目的為探討臺灣區域大冠鷲之遺傳結構，試驗動物樣本收集自臺北市立動物園 11 隻及行政院農委會特有生物研究保育中心 39 隻，共計 50 個樣本。利用粒線體細胞色素 b 基因區域 874 bp 之序列與 NCBI GenBank database 所提供的中南半島區域大冠鷲亞種之基因序列進行多重序列比對。分析結果顯示，臺灣與中南半島區域兩亞種間發現 8 個變異點；而在臺灣區域之大冠鷲 50 個序列樣本中可發現三個變異點，屬高度保留性，其中 9 個樣本於第 569 bp 位置發現有變異點，2 個樣本在第 672 bp 位置有變異點。而第 569 bp 之變異只發現於中
22、央山脈以西，玉山山脈以北的個體中，推斷可能是由於大冠鷲之分布上限為海拔 2500 公尺而造成之地理區隔；另上述變異點亦未於中南半島區域大冠鷲亞種發現，推測這些變異點可能為臺灣區域大冠鷲特有之遺傳變異。由上述細胞色素 b 基因之遺傳變異分析結果顯示，臺灣區域之大冠鷲可能因地理區隔而造成特有的遺傳變異。6. 文獻報告顯示，在外國品種豬隻：H-FABP、CRC、myogenin 及 MYF6 基因遺傳變異，皆與豬隻屠體性狀（品質）具有一定程度相關。然在臺灣黑豬這方面相關的報告仍不多。因此本試驗以台灣中南部 5 個黑豬場，共 496 頭臺灣黑豬為試驗豬隻，以 PCR-RFLP 方法進行臺灣黑豬族群 H
23、-FABP、CRC 、myogenin 及 MYF6 基因遺傳變異之探討。試驗結果顯示，H-FABP 基因之 HH、Hh 及 hh 基因型比例，於 A 和 C 兩場中沒有顯著差異（P 0.05），但其餘三場則分別與前述兩場有極顯著差異（P 0.05）；而 DD、Dd 及 dd 基因型比例在 A、C 和 D 三場中沒有顯著差異（P 0.05），但在另兩場分別與前三場有極顯著差異（P 0.05）。在 myogenin 基因方面，各場間之 AA、 AB 及 BB 基因型比例在 B 和 D 兩場中沒有顯著差異（P 0.05），但 A、C 及 E 三場則分別與前述兩場有極顯著差異（P 0.05），但 A
24、、C、D 三場則分別與前述兩場有極顯著差異（P 0.05），但 C、D 和 E 三場則分別與前述兩場有顯著差異（P 0.01）。7. 台灣水牛（Bubalus bubalis carabanesis）動情周期間孕酮及雌二醇濃度變化之研究：分析四頭母水牛之血液及糞便試樣中之雌二醇及孕酮，以評估動情周期中之變化。結果顯示在濾泡期血清中孕酮濃度為 1.1 0.2 ng/mL，雌二醇為 40.1 14.5 pg/mL，糞孕酮與糞雌二醇各為 161.0 30.2 及 49.9 14.1 ng/g；黃體期之血清中孕酮為 2.74 0.9 ng/mL，雌二醇為 30.6 10.0 pg/mL，糞孕酮與糞雌二
25、醇各為 230.9 52.1 ng/g 及 39.9 10.0 ng/g，血液與糞便之濃度變化趨勢相似。依據上述內泌素推算台灣水牛之動情周期平均為 20.5 1.2 天，濾泡期 6.8 0.9 天，黃體期為 13.8 1.0 天。本研究已成功應用於監測台灣水牛之生殖狀態。8. Kisspeptin 及 GPR54 在雄鼠睪丸之表現：本研究將以睪丸為主要研究組織，探討kisspeptin 與 GPR54 在睪丸中之定位與功能。利用免疫組織染色(IHC) 進行定位之實驗。結果發現 kisspeptin 與 GPR54 都高度表現於睪丸之萊吉氏細胞中，由此推測 kisspptin 可能分泌自萊吉氏細
26、胞並作用於萊吉氏細胞本身而形成自我分泌(autocrine)路徑。此外，以相同試驗技術實驗於四週齡之未發身小鼠，發現未發身小鼠萊吉氏細胞之 kisspeptin 與GPR54 表現量顯著低於發身後之小鼠。9. 玉山國家公園臺灣野豬遺傳親緣、外來豬種基因滲入與馴養狩獵文化之調查計畫：分析36 個玉山國家公園丹大地區臺灣野豬樣本粒線體 DNA 上 D-loop 片段多型性，顯示其親緣關係樹自成一個分支，其中 29 個個體在此分支內，分成 10 種基因單套型，其餘野豬個體則帶有蘭嶼小耳豬粒線體 DNA 序列，顯示部分野豬已遭受外來基因滲入。依據 19對微衛星標記檢測，平均對偶基因數為 7.58 個，
27、多態性指數為 0.683，其中 4 個標記顯著偏離哈溫平衡。玉山國家公園鄰近地區飼養戶混養家豬與野豬，或為家豬基因滲入至野豬個體之途徑。10. 發現 DHA 會增進 SAA 表現以降低一種保護脂肪油滴的蛋白質 perilipin 之基因表現量，闡明其基因表現調控機制，進而使脂質分解作用增加，發表 J. Biological Chemistry.論文。11. 發現一個大冠鷲與鳳頭蒼鷹性別鑑定分子標記，發現多個大冠鷲基因分子標記。12. 發明一種不胖鼠，產製其體幹細胞。13. 產製四種轉基因小鼠供研究之用，研究結果已經投稿，其中一篇已被 J. Nutritional Biochem 接受。14.
28、螢光基因轉殖小鼠及豬之研究成果：間葉幹細胞可分離自骨膜、骨小樑、脂肪組織、關節液、骨骼肌及脫落之牙齒，其在特定培養環境下具高增殖能力及可分化為多種細胞系特性，由許多臨床前及臨床之研究試驗中已證實間葉幹細胞在再生醫學及組織工程具應用之潛力及治療價值。此外，攜報導基因的間葉幹細胞經移植後之表現穩定性將有助於確認其在體內之功能及分化潛能。分離自表現報導基因之骨髓幹細胞具有相同之表現型式，此策略有助於追蹤其移植及分化後之命運。因此產製表現不同報導基因之轉基因動物將可滿足吾人對此獨特間葉幹細胞之需求。經由源自水母之綠色螢光蛋白質及源自紅珊瑚之紅色螢光蛋白質基因之選殖，並分別與 -肌動蛋白質之啟動子構築後
29、，以胚原核基因顯微注射方式已將轉殖之綠色及紅色螢光蛋白質基因逢機嵌入小鼠及豬之基因組中，並皆已獲得表現螢光蛋白質之基因轉殖小鼠及豬(圖 1)結果。15. 幹細胞及再生醫學之研究：進一步採集綠色螢光小鼠及豬之骨髓液進行間葉幹細胞之分離，可由體外試驗證實其分化為成骨細胞、脂肪細胞、軟骨細胞、分泌胰島素細胞及神經細胞之潛能；另於體內試驗結果亦確認此等間葉幹細胞具有修補骨質梳鬆症小鼠之硬骨及骨小樑之效果。在第一型糖尿病之小鼠模式研究結果亦證實間葉幹細胞體外誘導分化之可分泌胰島素之類胰臟 -細胞，經由將其移植於高血糖小鼠皮下，試驗結果證實具有降血糖之生物功能。生產技術學群：1. 種豬登錄資料庫之系統更新
30、與功能擴充：a. 修正系統中達到民國 100 年的年序問題現有系統年份之欄位長度均設定為兩位，為避免系統於日期進位之判斷產生錯亂，新系統已完成所有日期欄位調整。b. 歷史資料轉移、分析及關聯性重整將原有種豬登錄三十多年資料轉檔至新設置之種豬登錄資料庫系統中予以測試完成，並確認資料完整性。且利用資料回填功能，重建各表單資料關聯性，進一步恢復特定欄位唯一值特性。c. 已於中央畜產會種豬登錄辦公室設置完成種豬登錄資料庫新系統資料庫系統軟體程式組撰寫並測試可正常運作，另以網路操作介面提供登打使用者進行資料輸入、性能計算及證書列印等功能，同時改善資料輸入除錯邏輯，建立正確資料並可即時運算相關數據，提昇資
31、料處理速度。d. 完成線上查詢系統提供遠端使用者(種豬場業者及一般使用者)可透過網路連線進行登錄資料查詢、瀏覽、下載及列印。e. 完成系統需求手冊、系統分析手冊、系統操作及維護手冊之初稿撰寫，刻正修改內容以求確實有效，未來能夠提供系統操作、維護、發展及擴充等用途。2. 肌肉生長抑制素（Myostatin）是一種骨骼肌生長負調控因子的蛋白質，在分類上屬於轉化生長因子 （TGF- ）家族中的一員。相關文獻證明 myostatin （MSTN ）基因顯著影響骨骼肌的發育及增重。本試驗以 67 頭杜洛克（D ）、34 頭藍瑞斯（L ）、227 頭藍瑞斯杜洛克（LD）雜交豬及 18 頭藍瑞斯 約克夏杜洛
32、克（LYD ）雜交豬，共計 346 頭試驗豬隻，進行豬隻 MSTN 基因 promoter 區域（1-1242）共 1242 bp 序列之檢測，並於豬隻屠宰後，進行屠體資料收集及性狀分析。試驗結果顯示，在所定序的 1242 bp 中，在第 435 及 447 的位置具有多態性存在，分別為 G435A 及 A447G transition mutation。將此二個 SNP 與屠體性狀進行相關分析，結果顯示，G435A 變異，在所檢測之豬隻與屠體性狀中對豬隻屠體瘦肉重具有顯著的影響（P0.05 ）；另外， A447G 變異則除了對於瘦肉重（P0.05）有顯著影響外，還對於豬隻瘦肉率（P0.01
33、）、肌肉粗蛋白質含量（P0.05）亦分別具有極顯著及顯著的影響，而其中 MSTN promoter A447G transition mutation 中 GG 型豬隻瘦肉率顯著高於 AA 型（P0.05），且 AA 型豬隻瘦肉率也顯著高於 AG 型（P0.05）；在肌肉粗蛋白含量分析，則顯示 MSTN 基因 AA 型豬隻大於 AG 及GG 型；造成這個結果可能是由於骨骼肌中特有的 MEF3 轉錄因子無法結合在發生 A-G變異的位置，因而影響 myostatin 蛋白質的表現程度。3. 粒線體 DNA（mtDNA）多態性分析，為研究山羊遺傳類源重要的工具之一，Luikart et al.（20
34、01）分析不同國家及地區性的不同品種山羊個體之 mtDNA D-loop 高變異區序列，觀察到不同單套型 （haplotype ）序列，且可分類成 3 個高度分化的支系 A、B 和C（lineage A, B, and C）。而其它報告顯示，從 lineage A 中又可分出與其有變異點差異的 lineage D。為瞭解臺灣本地山羊粒線體 DNA 遺傳多態性，本試驗採集臺灣黑山羊100 頭，撒能（Saanen）30 頭、努比亞（Nubian）30 頭、土根堡（Toggenburg）29 頭、阿爾拜因（Alpine）30 頭及波爾（Boer ）山羊 27 頭，共計 246 頭試驗羊隻，利用 PC
35、R-RFLP 的方法，設計兩組之引子組，針對粒線體 DNA 中的特殊片段，進行 PCR 擴增，所得 PCR 產物片段大小分別為 506 及 496 bp，並使用 SalI、NsiI 及 NlaIII 三個限制酵素，進行限制酵素截切反應，期區分出 lineage A、B、C 及 D 四型。試驗結果顯示，在目前所檢測的 246 個山羊 mtDNA 樣本中，以 lineage A 結果的數目最多，約占 78.9%，其中臺灣黑山羊幾乎皆為 lineage A（97.0% ）；而努比亞、波爾、阿爾拜因、撒能及土根堡等其他品種則出現不同比例的 lineage B，分別為 40.0、74.1、13.3、30
36、.0 及 6.9%，其中以波爾山羊所佔數目及比例較高；另在阿爾拜因則發現 lianeage C 的樣本（3.33%），而lineage D 型則在目前所採樣的山羊樣本中並未發現。4. 文獻報告顯示 prion 基因多態性對於羊隻之羊搔癢症（scrapie）易感性具有重要的影響性，在雖然臺灣目前並無羊搔癢症例子的發現，然臺灣羊隻 prion 基因遺傳多態性資料之建立仍然是相當重要的。因此本試驗設計針對山羊 prion 基因特異性所設計之引子組，並利用 PCR 檢測恆春分所（64 頭）與花蓮種畜繁殖場（58 頭）之臺灣黑山羊族群，以及民間場之努比亞（30 頭）與波爾山羊（27 頭），共 179 頭
37、山羊之 prion 基因多態性，擬藉由 prion 基因多態性分析，初步瞭解臺灣羊隻 prion 基因之遺傳變異性。試驗結果顯示，利用所設計之引子對台灣黑山羊、努比亞及波爾山羊 prion 基因進行擴增後，可增幅出的產物片段為 1204 bp，將此產物進一步純化後定序，並經比對序列後，發現在此三種品種山羊 prion 基因，均可發現兩個胺基酸序列改變的多態性：H143R 與S240P；以及另外兩個沉默突變 (silent mutation)，分別為胺基酸序列第 42 (ccgcca ) 與第 138 (agtagc) 個胺基酸密碼子。此外，努比亞與波爾山羊在第 146 個胺基酸序列具有多態性
38、(NS)，而在努比亞山羊中，尚發現兩個胺基酸序列多態性，分別為 Q101R及 Q211R。由上述試驗結果分析，台灣黑山羊、努比亞及波爾山羊在 prion 基因序列具有 SNP 之遺傳多態性，而這些遺傳變異是否會影響此些品種羊隻感染羊搔癢症之易感性，則需進行更進一步的試驗研究。5. 執行國科會計畫瘤胃微生物之纖維分解酵素於農業廢棄物產製生質酒精之應用(NSC 98-ET-E-002-001-ET)，研究中將瘤胃微生物 Piromyces rhizinflata 之纖維素酶基因eglA、 Neocallimastix patriciarum 之木聚糖酶基因 xynCDBFV，以及 Saccharo
39、mycecopsis fibuligera 之葡萄糖苷酶基因 bgl1 分別以 S. cerevisiae INVSc1 表達，並將稻桿以石灰法處理後，再混合帶有纖維分解酵素基因之 S. cerevisiae 轉型株與 S. cerevisiae D5A 發酵菌株，以聯合生物加工法產製生質酒精。6. 執行國科會計畫多功能纖維分解酵素之開發與應用(NSC 98-2324-B-002-008)，利用基因工程技術將瘤胃真菌的纖維素酶、聚木糖酶，以及乙醯聚木糖酯酶基因進行接合，再利用酵母菌表達系統進行融合蛋白質的大量表達，以產製具有多功能纖維分解能力之嵌合體酵素。除探討嵌合體酵素的活性、酵素動力學、最
40、適作用條件等基本特性外，並利用發酵槽進行多功能嵌合體酵素之大量產製，再以本土農業廢棄物為基質，進行木質纖維素之水解試驗。7. 執行國科會計畫瘤胃真菌之雙功能纖維分解酵素-乙醯聚木糖酯酶/ 聚木糖酶的晶體結構及功能研究 (NSC 98-2313-B-002-033-MY3)，針對瘤胃真菌之雙功能纖維分解酵素-乙醯聚木糖酯酶/聚木糖酶 XynS20E 進行研究，除探討全長型及截斷型 XynS20E 重組蛋白質的各結構區活性、酵素動力學、最適作用條件等酵素基本特性外，並利用 X 射線結晶分析法針對該酵素及其與受質所形成複合物之晶體結構進行研究。8. 執行農委會計畫地衣芽孢桿菌微生物製劑之開發與應用
41、98 農科-2.1.4-牧-U1(10)，自台大農業試驗場分離出一株對黴菌毒素具有分解能力的菌株 CK1。以生理、生化及 16S rRNA 序列分析證實 CK1 為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。該菌株不具溶血性、不產生腸毒素，且具有極高的蛋白酶與纖維分解酵素活性。此外，B. licheniformis CK1 具有極高的分解黴菌毒素 zearalenone (ZEN)能力，將其培養於含有 2 ppm ZEN 的 LB 培養基 48 小時，92之 ZEN 可被去除。本研究證實 B. licheniformis CK1 具有應用於飼料中去除 ZEN 之潛力。9. 執
42、行農委會計畫台灣水牛瘤胃微生物基因資源之開發與應用 98 農科-2.1.2-牧-U1(3)，自台灣水牛分離純化一株厭氧真菌 Neocallimastix patriciarum S20，並自該菌分離出一條聚木糖酶基因 xynS20E，其轉譯之蛋白質 N 端具有碳水化合物酯酶第 1 族(carbohydrate esterase family 1)結構區(domain)，C 端具有糖苷水解酶第 11 族(glycosyl hydrolase family 11)結構區，且二者間具有二重覆之錨定(dockerin)結構區。以 XynS20E 之 N 端碳水化合物酯酶結構區和其他已知之碳水化合物酯酶
43、進行系統關係分析，證實其與已知之瘤胃微生物碳水化合物酯酶具有極大的差異。此為首次自瘤胃真菌發現具有乙醯聚木糖酯酶與聚木糖酶活性之雙功能纖維分解酵素的研究，該酵素不僅可供飼料及食品等相關產業發展應用，亦可應用於生質酒精及農業廢棄物處理等。10. 不添加重金屬皮蛋製程之研究：1.由於在較高溫且不添加氧化鉛或其他金屬鹽類條件下醃製皮蛋，其製成率與品質可能受到原料蛋蛋殼厚度,鮮度及蛋白黏稠度等因子影響，致成熟度不一，品質不穩定。2.進行環境溫度對菜鴨蛋殼強度(kg)及蛋殼厚度(mm)之影響，結果發現熱季組蛋殼強度(kg)低於涼季組，至於蛋殼厚度(mm)也是熱季組小於涼季組，又環境溫度對鴨蛋蛋白豪氏單位
44、之影響也發現熱季組小於涼季組但差異多不顯著。3.皮蛋製造方面採用二種方法分別為傳統法及加熱法，結果二種方法均可得到 95製成率，其中加熱法略優於傳統法，二種皮蛋產品均需配合真空包裝貯存四個月後蛋白，蛋黃色澤仍可維持正常，至於皮蛋產品重金屬含量及微生物含量均合乎標準。11. 肝纖維化動物模式之建立及應用：本研究已成功建立硫代乙醯胺(thioacetamide, TAA)誘發化學性肝纖維化齧齒類動物模式，並可應用於評估具預防肝纖維化功效之健康食品。而薑黃素、白藜蘆醇以及水飛薊應用於此一動物模式中均有預防肝損傷以及肝纖維化的功效。此外，本研究發現水飛薊預防肝纖維化的機制可經由抑制 KLF6 轉錄因子
45、的表現，進而減少 TGF-1 的表現量來抑制星狀細胞的活化並且減少肝臟組織中纖維的堆積。12. 平面式片膜箝制設備之研發：傳統的玻璃微電極片膜箝制（microelectrode patch-clamp）系統需要熟練操作員才能掌握，並不符合大量藥物等高通亮的需求。此研究開發出平面式片膜箝制（planer patch-clamp）系統，利用兩階段方式以雷射在蓋玻片上鑽出 2-3 m直徑孔洞。片膜箝制系統要能成功玻璃需要與細胞膜形成高於 109 的電阻 （gigaseal），以 HEK, CHO, 和 Jurkat 細胞株測試，形成 gigaseal 的成功率分別為 62.5%, 43.6% and
46、 66.7%。輔以微流體製程，進一步改良設備，以進行快速交換細胞內、外溶液，並能進行光學偵測，有利於細胞生理的研究。13. 動物福利方面：屠宰場動物福利檢查員設立之可行性分析及訓練課程之規劃。收集到英國動物福利員之訓練課程，並分析動物福利員訓練課程之內容。以問卷方式諮詢國內主要屠宰場業者對設置動物福利員及訓練課程之意見。規劃並設計適合國內狀況之動物福利員訓練課程。同時提出現階段國內可採行動物福利員制度之方式，以提供主事單位參考。14. 新開發飼料與芻料替代物於乳羊應用價值之研究：本研究比較兩種不同成熟度太陽麻以及花生藤分別與玉米以 40:60 比例混合製作青貯在泌乳羊飼養上的應用價值。泌乳山羊
47、餵食幼嫩太陽麻/玉米混合青貯、老熟太陽麻/玉米混合青貯、花生藤/玉米混合青貯以及對照組玉米青貯等四種飼糧之乾物質採食量，分別為 1.42、1.45、1.65、1.52 kg/day。餵食花生藤/玉米混合青貯混合飼糧者，乾物質採食量顯著高於其他三組。餵食前述四種青貯混合飼糧的平均乳量、乳脂率、乳蛋白率以及體細胞數，分別為1.75、1.78、1.95、1.90 kg/day;4.29、4.31、4.32、 4.36%; 3.06、3.03、3.15、3.05%;1.1、1.5、0.8、1.8 x 10 6/mL。綜合而言，太陽麻以及花生藤分別與玉米以 40:60 比例混合所製作青貯，在泌乳羊飼養的
48、產乳表現與玉米青貯相似。15. 加強飼料生產與衛生安全管理計畫：為維護家畜禽之營養與人類健康，加強飼料管理以提升飼料品質，政府補助進行加強飼料生產與衛生安全管理計畫。負責部分為對部分飼料原料與添加物之安全性評估，以供主管單位參考。16. 98 年度農業新時代-CAS 台灣優良產品宣導計畫-有機畜產品生產輔導：鑑於有機畜產品目前採強迫驗證方式，且國內對於有機生產之日益重視，為協助有意生產有機畜產品之經營業者，評估生產有機畜產品之可行性，並建立符合法律規範之有機畜產品作業。邀請相關專家學者組成有機畜產輔導小組，選擇數家有意從事有機畜產品之經營業者進行現場訪視及評估，若經評估可行性高者，則對經營業者
49、進行生產作業現場輔導，使業者之作業能符合法令規範，以便取得驗證。17. 輔導續產業產銷轉型升級計劃飼養管理之輔導：由於飼料價格高漲，廚餘與地方性副產物於黑豬飼養的使用增加，然因此類產品成分變異大且產量不隱定，加上黑毛豬品種不同於白毛豬，頗為複雜。本計劃對廚餘部份進行採樣分析，並就分析結果，建議養豬戶進行調整，以調高飼料利用等。18. 畜牧產業之研究與改進-飼料安全之管理與監控：因應計畫需求，收集、整理及翻譯國外管理寵物食品之相關法規，以供主管機關研議寵物食品衛生安全管理規範之參考。先後已收集有美國、歐盟、澳洲及日本等國的法令。另外為達培訓人員之要求，訓練研究助理進行市售寵物食品之採樣及儲存性試驗，進行儲藏試驗及採樣分析，以了解營養含量及環境對飼糧儲存的影響。19. 環保豬之研究：利用澱粉酶啟動子驅動纖維分解酶（cellulase）與植酸酶（phytase）等分解酵素基因時，轉基因豬中糞磷含量變化之消化試驗分析結果顯示，正常磷試驗組中，轉基因豬之糞磷含量比非轉基因豬之糞磷含量減少 29.12；低有效磷試驗組中，轉基因豬糞磷含量亦比同組中之非轉基因豬糞
