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chemdraw-09-Chem3D实例指导.ppt

1、9 1利用键工具建立模型 9 2利用ReplacementText建立模型 9 3检查结构能量 9 4ChemDraw和Chem3D信息转换 9 5分子轨道 HOMO及LUMO 9 1利用键工具建立模型 Chem3D起始界面 9 1利用键工具建立模型 Chem3D起始界面 选择 轨迹球 单键 双键 三键 虚键 文本 橡皮 显示设置 显示设置属性 线状模型 棒状模型 球棍模型 圆柱键模型 比例模型 带状模型 选择 单键 工具 在模型窗口向右按动 圆柱键模型 线状模型 棒状模型 球棍模型 比例模型 带状模型常用于生物分子 选择 轨迹球 工具 使分子模型在模型窗口沿X Y轴旋转 X Y轴旋转指示 选

2、择 轨迹球 工具并按 Alt 键 使分子模型在模型窗口沿Z轴旋转 Z轴旋转指示 模型结构信息 光标位于原子上 自动显示原子信息 光标位于键上 自动显示键信息 模型结构信息 模型的进一步信息 模型的键长数据 模型的键长和键角数据 乙烯模型中的双键信息 键级改动 显示氢及孤对电子 不显示氢及孤对电子的环己烷 原子名称及序数 选择工具 双击原子 按顺序改变原子序号 利用 键 工具建立的结构 键角及键长可能不正常 应 整理结构 环己烷的椅式构象 9 2利用ReplacementText建立模型 使用 文本 工具输入结构式 按 Enter 自动转化为模型 括号表示支链 整理结构 简单优化 4 甲基 2

3、戊醇模型 建立1 2 双甲基环戊烷模型 整理结构 建立Ibuprofen 布洛芬 模型 建立十肽菌素模型 建立十二丙氨酸醇分子模型 改变显示方式 设为线状模型 设为带状模型 a 螺旋模型 使用子结构建立模型 子结构模型库 选择所需的子结构 然后复制 粘贴复制结果 在子结构上进行编辑 9 3检查结构能量 模型旋转 对位交叉 总能量计算 空间位阻能 0 977kcal mol 计算结果 模型的二面角数据 数据与模型对应 显示原子符号及序号 按动旋转 数据相应改变 对位重叠 空间位阻能 3 906kcal mol 计算结果 9 4ChemDraw和Chem3D信息转换 ChemDraw中画出的分子结构 复制粘贴到Chem3D中 Chem3D中画出的分子模型 复制粘贴到ChemDraw中 9 5分子轨道 HOMO及LUMO 显示轨道时必须选择 选择分子轨道 选择HOMO轨道 HOMO轨道显示 乙烯分子的HOMO轨道 选择LUMO轨道 LUMO轨道显示 乙烯分子的LUMO轨道

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